基于转录组分析对水稻卷叶发育的SRL1调控网络的研究

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SRL1(SEMI-ROLLED LEAF 1)与CLD1(CURLED LEAF AND DWARF 1)互为等位基因,编码一种假定的糖基磷脂酰锚定的膜蛋白,被认为是一种参与水稻叶片形态调控的基因。srl1-1突变体(点突变体)和srl1-2突变体(DNA插入突变体)在叶片发育过程中均表现出形态缺陷,导致叶片呈现正向卷曲的表型。为了探索SRL1在水稻叶片发育中的基因调控网络,我们利用CRISPR/Cas9基因编辑系统构建了一个纯合的敲除株系(srl1-KO),该株系在水稻叶片发育过程中表现出正向卷曲的表型。通过比较SRL1敲除的纯合株系(srl1-KO)与SRL1未敲除的对照组(non-KO)的叶片转录组数据,发现共有3178个差异表达基因,其中1216个基因显著上调,1962个基因显著下调。进一步分析表明,在srl1-KO中,一组已知的与卷叶发育相关的基因参与调控叶片泡状细胞和角质层的发育,包括Os ZHD1、Os LBD3-7、RFS、ACL1、CFL1、SND1、Os CESA5和Os CESA6等,这些基因在srl1-KO中的表达量显著上调或下调。这表明在叶片的泡状细胞和角质层细胞等叶细胞的细胞学结构方面,SRL1可能通过调控一系列影响泡状细胞和角质层的基因来调控叶片的卷曲。
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