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目的：脑梗死是神经内科最为常见的疾病，也是国内成年人第一大死因和致残因素，从多方面寻找其致病机制并找到合适的预测指标十分重要。神经病学中常见疾病如阿尔茨海默病、帕金森病以及脱髓鞘等疾病在遗传学角度的研究较多，而对于脑梗死在这方面的研究相对较少。本研究选择的烟酰胺磷酸核糖转移酶(Nicotinamide phosphoribosyl transferase，NAMPT)和对氧磷酶(Paraoxonase，PON)家族基因被认为与脑梗死的发病有着紧密的联系，而染色体末端的端粒长度的差异和心脑血管疾病发病风险同样存在着关联。本研究旨在从表观遗传学角度评估NAMPT基因、PON家族基因（PON1，PON2和PON3）启动子区DNA甲基化水平及染色体末端的DNA序列即端粒长度与脑梗死患者发病的相关性，并进一步探究其作为潜在生物学标志物的可能。 方法：使用病例对照的研究方法，选取152例脑梗死患者为病例组，152例性别、年龄匹配的健康人为对照组，采外周静脉血并从中提取基因组DNA，使用荧光定量甲基化特异性PCR(Quantitative methylation-specific PCR，qMSP)测定两组受试者的血液NAMPT、PON1、PON2、PON3基因甲基化水平及检测绝对端粒长度。以甲基化参考百分比来表示每个样本的甲基化水平(Methylation reference percentage，PMR：％)来表示，进一步综合分析与脑梗死的相关性。 结果：NAMPT基因在病例和对照组样本的甲基化率均很低(病例：24.59％vs对照19.69％，P=0.551)，两组甲基化水平值无明显差异，而PON2基因在病例和对照组中的甲基化率几乎为0。PON1甲基化水平(％)在病例组中显著高于对照组(Z=-3.898，P=0.0001)。PON3甲基化水平(％)在病例组中显著低于对照组(Z=-3.098，P=0.002)。性别亚组显示PON1和PON3两组的差异均在男性中更为显著(PON1，Z=-3.786，P=0.0002;PON3，Z=-2.709，P=0.007)。病例组患者的端粒长度显著低于对照组(Z=-11.843，P＜0.0001)，无明显性别差异。将PON1和PON3两者甲基化水平相对比，在病例和对照两组中均具有很显著的相关性(病例：r=0.418，P=0.0001;对照：r=0.3，P=0.0002)。然而，并没有发现PON1、PON3甲基化水平与端粒长度的相关性(病例：r=0.023，P=0.775;对照：r=-0.157，P=0.054)。 回归分析提示PON3的甲基化水平升高是脑梗死的一个保护因素[OR(95％CI)=0.979(0.96-0.999)，P=0.035）]，端粒长度同样是脑梗死发病的保护因素[OR(95％CI)=0.748(0.681-0.823)，β=-0.29，P＜0.0001]。用筛查诊断能力的ROC曲线，将PON3甲基化水平和端粒长度对脑梗死的诊断能力进行分析，提示PON3甲基化对脑梗死具有很低的诊断价值(AUC=0.605，95％CI=0.541-0.669，敏感度88.7‰特异度35.5％，Cut off=17.97，P=0.002);端粒长度是预测脑梗死发病较好的一个指标(AUC=0.894，95％CI=0.851-0.937，敏感性84.7％，特异性93.4％,Cut off=0.0473,P＜0.0001)。 结论：NAMPT、PON2启动子区甲基化水平与脑梗死发病无关;PON1启动子区高甲基化和PON3低甲基化与男性脑梗死患者发病风险有关，较短的端粒长度与脑梗死发病风险相关，这与性别差异无关。PON1和PON3甲基化可能有相互影响的作用，而PON家族基因甲基化水平与端粒长度无显著相关性。PON3甲基化水平对脑梗死有较低的诊断价值，端粒长度可作为脑梗死潜在的诊断标志物。