目的:本研究收集妊娠期糖尿病（Gestational diabetes mellitus,GDM）患者及正常孕妇在早孕期、晚孕期和产后期的粪便标本,分析其肠道菌群结构及临床特征,通过早孕期、晚孕期及产后期菌群改变的纵向自身对照及与正常孕妇的横向对照,探讨妊娠期糖尿病与肠道菌群结构特征的关联,希望能为通过调节肠道菌群来干预GDM的发病提供实验依据。方法:选取2018年3月至2019年3月期间,在厦门大学附属第一医院产科产检并且符合标准的54名孕妇作为研究对象,收集相关临床资料,按照葡萄糖耐量试验（OGTT）结果分为实验组（GDM组,n=27）和对照组（N-GDM组,n=27）。收集两组孕妇在早孕期、晚孕期、产后期的粪便标本,并提取粪便标本中菌群总DNA,采用高通量测序平台对菌群的16s r RNA进行测序,通过生物信息学分析及统计学处理,分析N-GDM组孕妇及GDM组孕妇在妊娠过程中的菌群特征。结果:1.GDM组和N-GDM组的年龄、孕前体重、孕前体重指数、孕产次、基础血压等临床指标没有显著差异。两组的总孕期体重增长值无明显差异,而晚孕期GDM组的体重增长值显著低于N-GDM组（P<0.001）。两组的饮食、运动、睡眠方面没有统计学差异。2.各时期中GDM组和N-GDM组的可操作单元各自聚集,区分良好。其中在晚孕期GDM组的OTU总数显著高于N-GDM组（P=0.048）。早孕期、晚孕期N-GDM组孕妇的独立OTU数量逐渐下降,而GDM组孕妇的独立OTU数量则逐渐升高。3.在早孕期GDM组的shannon指数以及simpson指数显著升高（P=0.025、0.018）,Beta多样性显著低于N-GDM组（P=0.002）。在晚孕期,GDM组的observed species指数、ace指数、chao指数显著升高（P=0.045、0.041、0.034）。在产后期各个Alpha指数的差异无明显统计学差异,而Beta多样性显著高于N-GDM组（P<0.001,P=0.004）。在N-GDM组,早孕期、晚孕期、产后时期的ace指数显著降低（P=0.020）;而GDM组多样性变化不显著。4.GDM组和N-GDM组的肠道菌群组成均以拟杆菌门和厚壁菌门为主,其次是变形菌门及放线菌门,其中早孕期GDM组放线菌门的丰度显著高于N-GDM组（P=0.026）。在早孕期、晚孕期、产后期三个时期的自身纵向比较中,无论是GDM组还是N-GDM组均表现出早孕期和晚孕期的菌群结构较相近。5.两组在早孕期有显著差异的菌群有7种,其中GDM组的特征菌群为放线菌门,N-GDM组的特征菌群为螺旋体门。在晚孕期,有显著差异的物种有14种,其中GDM组的特征菌群主要为立克次氏体目、红杆菌目、红杆菌科,而N-GDM组的特征菌群是组织菌科。产后期的两组菌群分析未见明显差异菌属。6.放线菌门、红杆菌目、丁酸球菌属、吉米菌属及脱硫弧菌属与血糖水平呈显著正相关,而螺旋体门与血糖水平呈显著负相关。变形菌门、嗜血杆菌属、拉氏杆菌属与体重具有显著正相关性,而厚壁菌门、韦荣菌属与体重具有显著负相关性。结论:相较于健康孕妇,GDM孕妇肠道菌群结构发生重塑,整体的物种多样性较健康孕妇高。在早孕期GDM孕妇的放线菌门、拉氏杆菌属、丁酸球菌属的菌群丰度显著高于健康孕妇;在晚孕期,红杆菌目、脱硫弧菌属的菌群丰度显著高于健康孕妇。综上所述,GDM与肠道菌群结构调整具有密切相关性,但是具体作用机制有待进一步研究。