近年来，我国建筑产业方兴未艾，市场中的竞争也不断加剧，人们渐渐地开始关注如何在预定的工期目标内高质量的完成工程项目，降低工程成本，提高工程效益。其中水利项目的施工，由于工程持续时间长、资金投入规模大、涉及的工作多、施工条件多变，且易受周围环境的影响，因而如何确定组织施工安排十分复杂，这也是设计的难点。同时，全面有效的优化理论和方法的缺乏也是制约施工管理水平有效的进展原因之一。本文对复杂条件下的流水施工组织设计进行了优化和建模分析与应用研究。取得的研究成果如下：　　（1）说明了在工程的全生命周期中，水利工程在施工阶段的资金投入是最大的，因此对这一阶段进行施工组织设计，优化资源的投入对建筑的全过程控制都有很大的意义。阐述了工期和工程成本之间的函数关系，对后续模型的建立奠定基础。　　（2）建立复杂情况下的流水节拍和资源投入之间的关系模型，并从工程施工的工期和成本这两个方面进行优化研究，对不同条件下的优化结果进行了讨论和总结。结合启发式的遗传算法技术，对施工中如何合理的安排资源的投入进行了定量的分析。　　（3）用Matlab语言编制了资源投入与成本和工期之间的遗传算法程序。对本文所建立的优化模型进行了简单的验证和分析。　　（4）以某工程的渠道衬砌部分为例，利用本文所建优化模型对比优化前后施工进度计划中流水节拍、人员配置、工期和成本的差异，说明本文所建立的优化模型在水利工程流水施工组织设计中应用的可行性。