移民工程是一个复杂的系统工程，牵涉到公平、贫困、地区差距、利益冲突、社会稳定、生态平衡等一系列问题。伴随着城镇化建设、西部大开发和水利水电工程建设将会产生更多的移民，目前国家的对移民的前期补偿多是一次性的现金支付，政府出台的后期扶持政策更多的是一种短期救济行为，移民未能享受水电建设所带来的经济成果，水库移民仍然存在陷入贫困的风险，使移民真正成为水电建设的受益者是本文重点解决的问题。通过建立公平、合理、科学的效益分享机制实现水库淹没区和受益区的利益均衡，移民参与水电工程的效益分配，优化库区产业结构，充分调动移民的主观能动性，提高移民就业率，改善移民的收入水平，最终实现库区社会、经济、环境的可持续发展。 　　本文首先对效益分享机制的国内外研究现状和相关的理论进行了评述，提出了效益分享机制的研究思路和方法。其次，阐述了基于效益分享机制的帕累托理论、外部性理论、包容性理论、利益相关者理论等四大理论。分析了效益分享机制的产生和发展历史，并对我国主要存在的四大效益分享机制优缺点做了相应的比较分析，提出了目前效益分享机制存在的六大问题。最后对水库移民效益分享机制做了改进分析，包括效益分享机制的改进目标、改进障碍、改进内容以及建议和对策研究。实证分析是以三峡水库为例，概括了三峡水库经济社会发展状况，以及三峡库区效益分享的实施状况，对三峡工程综合效益和移民投入进行相应分析，最后对三峡库区完善效益分享机制提出了六大措施，包括鼓励外地投资、增加优惠政策，增加效益分享资金来源，提高移民身份，完善移民参与机制，深入开展三峡库区对口支援建设，建立中小企业创业基金和社会保障基金。