利用SSCP研究大青杨和香杨的种间及种内群体遗传多样性

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以大青杨5个种群41个无性系和香杨4个种群29个无性系为实验材料,根据在NCBI上检索的cDNA序列设计的5对引物,应用PCR-SSCP(单链构型多态性)技术研究这两个种的群体遗传多样性。所得结果如下:1.大青杨的群体遗传多样性分析:(1)在大青杨群体中,检测到5个位点,5个位点全部为多态位点,多态位点百分比达到100%。大青杨种群间多态位点百分比变化范围为80-100%。(2)用Nei基因多样性指数和Shannon信息指数估算遗传差异,在大青杨5个种群中,临江种群遗传变异最大,而清原种群的遗传变异最小。(3)大青杨种群间遗传分化系数比较小。Shannon遗传分化值为0.1620。在大青杨群体总遗传变异中,有83.80%存在于种群内,群体间遗传变异只占总变异的16.2%。Nei遗传分化系数为0.1072。在群体总遗传变异中,有89.28%存在于种群内,群体间遗传变异只占总变异的10.72%。(4)通过遗传距离矩阵聚类分析,将大青杨5个种群划分为3类:帽儿山和东方红种群为Ⅰ类,露水河和临江种群为Ⅱ类,清原种群为Ⅲ类。(5)大青杨各种群的遗传距离与地理距离之间无显著的相关关系。2.香杨的群体遗传多样性分析:(1)在香杨群体中,检测发现了5个位点,多态位点百分比达到100%。(2)利用Nei基因多样性指数和Shannon信息指数估算遗传差异,证实在香杨4个种群中,山河屯种群遗传变异最大,而汤旺河种群的遗传变异最小。(3)香杨种群间遗传分化系数比较小,Shannon遗传分化系数为0.0944。种群间遗传变异占种内总变异的9.44%,种群内变异占种内总变异为90.56%。群体间的遗传分化系数为0.1140。在香杨群体总遗传变异中,有88.6%存在于种群内,群体间遗传变异只占总变异的11.4%。(4)通过遗传距离矩阵聚类分析,将香杨4个种群划分为2类:汤旺河和山河屯种群为Ⅰ类,塔河和呼中种群为Ⅱ类。(5)香杨各种群的遗传距离与地理距离之间无显著的相关关系。3.大青杨和香杨群体遗传关系:大青杨和香杨的遗传一致度为0.9071,遗传距离为0.0975。说明大青杨和香杨的亲缘关系比较近。
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