本文从工业结构优化的视角出发，以南京“九五”和“十五”期间工业及其内部结构为研究对象，对南京工业结构进行了实证分析与评价。 根据工业结构演变规律、工业化阶段说及工业结构软化理论，本文对1996～2005年间南京工业结构高级化进程进行了分析。研究发现，从工业结构的演变角度分析，南京工业结构高级化进程与库茨涅茨标准产业结构较为类似；从工业结构现状角度对比分析，2005年南京工业结构与20世纪60年代的日本、70年代的台湾和90年代的韩国产业结构相似；从工业化进程角度分析，南京处于工业化中期重化工业化高加工度化阶段；从工业结构软化进程角度分析，南京工业对技术、知识等“软要素”的需求程度有所上升，但工业发展仍较大的依赖物质投入。综合看来，南京处于工业化中期重化工业化阶段，一方面工业结构正由高加工度化阶段向技术集约化阶段转化，但另一方面却难以摆脱以原材料工业为主的重化工业化的特征。 结合南京工业结构高级化进程，本文利用因子分析法对南京34个工业行业从结构、效益、资源和能源集约化、环境污染、科技投入等多角度进行评价。结果证明，南京工业结构基本合理，工业结构对市场需求结构的适应能力较强，电子、汽车、石化和钢铁等支柱产业具有较明显的比较优势，但仍然存在一些问题：第一，从工业结构高级化进程角度来看，工业结构层次偏低，给资源、能源和环境带来较大压力；第二，与国内同行业比较，南京的电子、汽车、钢铁等支柱产业的竞争力有待加强；第三，与国际先进制造水平相比，南京重要工业产品的加工深度不足；第四，与发达国家和地区相比，南京工业科技投入不足，自主创新能力不强。 根据上述实证分析，在分析工业结构优化实现机制的基础上，本文提出了南京工业结构优化的对策建议：一是坚持环境友好，实现产业转型，以新兴产业为主导，改进生产工艺装备，优化工业布局结构，实施循环经济改造；二是多管齐下，提升支柱产业的核心竞争力，配套与延伸现有优势产业链，鼓励优势产业“走出去”，培育知名品牌；三是发挥科教优势，由资本驱动转向创新驱动，共同推进工业结构和产业结构高级化与合理化，加强官产学研的联结，政府引导，企业参与，加快高技术密集型工业的发展，将新兴产业培育成新的增长点。