近年来,我国的经济建设飞速发展,国家的综合实力不断提升,资金在各个经济领域内投入不断加大,与此同时,规模较大的工程项目政府同样进行了投资。结合当前国际的审计发展态势,较发达的国家其审计模式已经从事前审计模式变为跟踪审计模式。在全球多个国家,越来越多的政府投资建设项目的审计模式,都开始采用跟踪审计这一科学的审计模式;反观我国,在面对政府投资建设项目的审计,通常采取的是事后审计,也就是在工程项目结束之后所开展的审计方式,而面对国内与时俱进的经济发展态势,这种审计模式己经很难做出有效的成绩。所以,一个科学合理的审计方法应运而生。跟踪审计作为一种可以贯穿建设项目全周期的一种审计模式,不但是一种全新的审计概念,同时,在项目前中后期的工程活动中,对国有资产的投入及产出进行了有效的监督,确保了资金使用的效益,得到了相关部门乃至整个社会的广泛认可。作为经济建设的重要组成部分,高速公路建设的相比其他工程,投资金额较大,相对的资金风险也就会越大。所以这样大金额的资金利用,时刻受到国家相关部门乃至整个社会的高度重视。因此,为了对政府投资建设项目跟踪审计中频发的问题与其问题的成因进行研究分析,论文以JZ高速公路建设项目建设的跟踪审计为案例,进行了相对系统的分析和说明。同时,借助系统免疫、经济责任以及生命周期的理论指导,从全过程跟踪审计的总体目标出发,结合我国相关的政策法规,对论文中JZ高速公路案例的跟踪审计方法进行了分析并提出了一些科学的建议以及优化措施,从而使全过程政府投资建设项目的理论与实践进一步的融合,优化我国跟踪审计理论框架,使其更加科学并对帮助政府相关部门的审计工作愈加系统和完善。