河南汉族人群肺结核与CCL5基因多态性相关性分析

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背景和目的肺结核(pulmonary tuberculosis、TB)是一种由结核杆菌导致的高度传染性疾病。筛选肺结核易感基因,并确定相关基因在结核病发病中的作用,对阐明结核病的发病遗传基础和分子机制,从遗传和基因角度针对性地采取预防措施,开发研制基因疫苗和治疗药物奠定基础。近年来,随着分子生物学的迅猛发展,尤其是人类基因组学和蛋白质组学的发展,宿主易感基因在肺结核病发生发展中的作用越来越受到重视。趋化因子是一类小分子分泌性蛋白质。可受化学诱导物及细胞因子调节,刺激炎性细胞产生趋化运动。其中趋化因子5 (CC chemokine ligand 5, CCL5) (CCL5)主要作用是诱导、激活和辅助其他细胞因子共同刺激T细胞和单核细胞,导致白细胞介素-2受体的表达,细胞因子释放和T细胞增殖,在免疫调节和炎症过程中起着重要作用。因此,CCL5基因在病理过程中的作用受到越来越广泛的关注。生化代谢和免疫学等研究发现,结核分枝杆菌感染的巨噬细胞内趋化因子5的表达水平发生改变,并与TB发生密切相关。但目前CCL5基因与肺结核相关报道极少且结论不一,国内尚未见相关报道。本文采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,观察CCL5启动子区域rs2280788:-28C/G和rs2107538:-403G/A两个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)位点在中国河南汉族人群中的分布情况,同时进行TB危险因素分析,旨在探讨CCL5启动子区域两个单核苷酸多态性在TB发生过程中的作用,为TB发病机制研究提供资料。方法患者组241例,纳入标准均符合中华人民共和国卫生部通告[2008]2号文件的WS 288-2008肺结核诊断标准。对照组选取270例同期健康体检的随机个体。2组间性别、年龄匹配,均排除糖尿病、HIV感染、使用肾上腺皮质激素及其它免疫抑制剂等。所有研究对象取外周静脉血2ml,2%EDTA抗凝,标准酚-氯仿法提取基因组DNA。采用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性技术扩增目的片段并用HincⅡ和RsaI酶切扩增产物,2.5%的琼脂糖凝胶电泳,在紫外成像仪上检测分析结果。以基因计数法计算TB患者与正常人群的基因型,用Hardy-Weinberg平衡及相关性检验评估标本群体代表性。应用SPSS 17.0软件包作统计学处理:χ2检验TB病组与正常人群之间基因型和等位基因频率差异,计算比值比(Odds Ratio,OR)及95%可信区间(CI),检验水准α=0.05。结果1.在河南汉族人群中,CCL5基因rs2280788多态性分布在TB组与对照组相比无显著差异(P>0.05)。2.在河南汉族人群中,CCL5基因rs2107538多态性分布在TB组与对照组相比,AA. AG、GG三种基因型和G、A等位基因频率均具有显著性差异(P<0.05)。3.对rs2107538位点和rs2280788位点进行单体型分析,。单体型分析发现C-A明显高于对照组(P<0.05),G-A低于对照组(P<0.05)。4.对rs2107538位点基因型和rs2280788位点基因型进行联合分析,CC/AG低于对照组(P<0.05),GC/AA、GC/AA、GC/GG、CC/AA高于对照组(P<0.05)。5.CCL5基因rs2107538位点和rs2280788位点多态性的分布与西班牙相似,与中国香港存在显著差异。结论1.在河南汉族人群中,CCL5基因rs2107538位点可能是TB患病的风险因素。2. CCL5基因rs2107538位点和rs2280788位点分布在河南汉族人群中与其他地区和种族之间存在差异。
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