在全球性气候变化、生态系统服务功能不断下降和生物多样性丧失日益严重的背景下，生物多样性保护成为人类所关注的最热点话题之一。生物多样性研究旨在揭示生物群落内或群落间多样性变化的内在机制。本研究在局地和地区两个空间尺度上，分别研究了啮齿动物α-功能多样性和多个类群（啮齿动物、蚂蚁和种子植物）的物种、谱系β-多样性的垂直变化格局及其内在机制。　　近年来，以种间功能相似性为基础的功能多样性（α-多样性）分析方法越来越多的被引用到探讨群落构建机制的群落生态学研究中。众所周知，生物群落的构建及其不同维度上的外在表现（物种、谱系和功能）是进化历史过程和生态过程相互作用下的结果。如何拆解不同过程在群落构建和多样性形成中的作用，成为目前生物多样性研究所要面临的一大挑战。以中国西南部横断山区啮齿动物群落为研究对象，本研究的第一部分期望解决以下问题:(1)确定啮齿动物群落功能（个体大小、尾长-体长比、食性特征及三个特征的综合）结构特征沿海拔梯度的变化格局;(2)比较和量化环境、空间和种间谱系关系在解释群落功能结构特征中的贡献;(3)检验贝格曼法则和艾伦法则在群落水平上解释啮齿动物个体大小和尾长-体长比沿海拔梯度变化格局中的适用性。本研究中的分析结果表明:不同的功能特征由于在群落构建中的作用不同表现出不同的空间变化格局;随海拔的升高，同一性状的结构特征受到不同作用（例如，生境过滤和种间竞争）的影响;空间变化和环境变化对群落功能结构变化的解释度较高，从而说明群落构建是生态位过程和中性过程共同作用下的结果;尽管三个功能性状均表现出显著的系统发育信号，种间谱系关系对功能结构特征空间变化格局的解释度较低或不显著，说明显著的系统发育信号不足以说明谱系关系可以替代功能相似性;功能性适应是物种适应环境过程的在不同性状上的综合表现，单一性状的经验法则（例如，贝格曼法则和艾伦法则）不足以解释这一复杂过程。　　生物多样性随空间和环境梯度的变化（β-多样性）及其内在机制一直是生物多样性研究中热点问题。在过去的几十年间，群落β-多样性研究在分析方法上取得了大量突破性的进展（例如，不同类群间的比较研究、β-多样性分解和随机化过程的引入）。但很少有研究尝试整合不同研究方法的思想，为β-多样性的空变化格局提供一个更为系统和全面的理解。以西藏色季拉山东坡的啮齿动物、蚂蚁和种子植物为研究对象，本研究的第二部分旨在解决:(1)明确物种和谱系β-多样性及其转换和嵌套组分随海拔距离的变化格局;(2)通过比较研究的方法，进一步明确多样性维度、谱系尺度和物种的扩散能力对β-多样性的影响;(3)通过随机化处理，检测生态位过程和中性过程在β-多样性空间变化格局中的相对重要性。线性回归分析的结果表明，物种和谱系β-多样性（相异性）及其转换组分随海拔距离的增大而增大;非参数检验的结果表明:物种β-多样性显著高于谱系β-多样性，物种转换显著高于谱系转换;物种和谱系β-多样性及其组分均表现出显著的谱系尺度依赖性;动物（啮齿动物和蚂蚁）群落的物种和谱系转换要显著低于种子植物群落的物种和谱系转换。物种和谱系β-多样性是生态位过程和中性过程相互作用下的结果。生态位过程在较高的谱系尺度下对群落间多样性变化的影响更加明显。以上结果表明，群落多样性的空间变化是在物种受到生态位过程和中性过程统统作用的产物。研究中所涉及的多样性维度、谱系尺度和研究类群的扩散能力等均影响群落间多样性差异的强度。