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鳜鱼在我国水产养殖中已占有十分重要的地位，但在鳜鱼养殖生产中尚存在许多亟待解决的问题，其中优良品种的选育是最重要的问题之一。秋浦河鳜鱼是我省选育中的一个地方品种，具有生长快、抗逆性强等优良特性，已形成一定的繁殖与养殖规模，并成为我省池州市重点推广的名牌产品；但对其遗传基础的研究尚属空白，本试验对秋浦河鳜鱼、长江鳜鱼和万佛湖鳜鱼进行同工酶和RAPD分析，以便为秋浦河鳜鱼的选育与推广提供基础资料。 首先，本试验采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对我省三个水域鳜鱼群体3种同工酶(LDH、Est、MDH)的不同基因座位进行了检测，结果表明：LDH同工酶可以作为区分秋浦河鳜鱼、长江鳜鱼两个群体与万佛湖鳜鱼群体的生化遗传标记； 其次，运用RAPD技术分析了三群体鳜鱼的基因组DNA的多态性。20个引物中有12个在三群体间产生多态性，这12条引物在秋浦河鳜鱼中扩增出了60条带，其中15条为多态性(占25％)；长江鳜鱼59条带，15条为多态性(占25.4％)；万佛湖鳜鱼58条带，19条为多态性(占32.8％)。每个引物产生的条带数在1-9之间，扩增片段大小在125bp-3.0kb之间。根据RAPD扩增产物对三群体遗传结构的分析表明： 1．秋浦河鳜鱼、长江鳜鱼、万佛湖鳜鱼群体内的遗传相似性系数分别为：0.9063、0.8839、0.8931；群体间的遗传相似性系数分别为：秋浦河鳜鱼和长江鳜鱼0.8590、秋浦河鳜鱼和万佛湖鳜鱼0.7956、长江鳜鱼与万佛湖鳜鱼0.8178。可见秋浦河鳜鱼群体内遗传相似性较高(0.9063)，并高于它与长江鳜鱼的群体间遗传相似性系数(0.8590)。表明经选育后，秋浦河鳜鱼与长江鳜鱼产生了一定的分化。 2．秋浦河鳜鱼与长江鳜鱼的遗传距离较近，为0.0411；秋浦河鳜鱼与万佛湖鳜鱼的遗传距离较远，为0.1766；而长江鳜鱼与万佛湖鳜鱼的遗传距离为0.1230。说明秋浦河鳜鱼与长江鳜鱼的亲缘关系较万佛湖鳜鱼更近，这与三者的地理分布是相符的。 3．OPZ05在三群体问扩增出了有差异性的DNA片段，可作为鉴定三群体的分子遗传标记。