本研究以‘融安金柑’及其实生变异品种‘滑皮金柑’为材料,比较两品种果实发育期的大小、色泽、可溶性糖和有机酸变化,并对果实发育的3个关键期(90 DAF、180 DAF和210 DAF)的果皮和果肉进行转录组分析,筛选调控金柑糖酸代谢的关键基因,阐述两金柑品种糖酸代谢差异的分子机理。主要结果如下:1.与‘融安金柑’相比,‘滑皮金柑’的果实更大,单果重较高,果实的形状接近球形。‘滑皮金柑’果皮和果肉中的可溶性糖含量更高。对糖组分分析发现,两品种果皮和果肉中主要积累的糖为蔗糖,且整个果实发育期‘滑皮金柑’果皮和果肉中的蔗糖和葡萄糖含量更高。此外,‘融安金柑’果肉中有更高的可滴定酸积累,尤其是在果实发育的前期。通过对有机酸成分的检测发现,两金柑品种积累的有机酸主要为柠檬酸、奎尼酸和苹果酸。三种有机酸在120-150 DAF与可滴定酸有一致的下降趋势,并且在‘融安金柑’中的含量更高。2.转录组分析发现,蔗糖磷酸合成酶基因(sjg023350和sjg087030)分别在‘滑皮金柑’果皮果肉90DAF有上调表达,而果肉中所有检测到的蔗糖转化酶基因(sjg074620、sjg284190、sjg290780、sjg318030、sjg097240、sjg274390、sjg286780)、果糖激酶(sjg293340、sjg298920、sjg113880)、己糖激酶(sjg162090)在果实发育不同时期呈一致下调表达。说明‘滑皮金柑’中的参与蔗糖合成的蔗糖磷酸合成酶在果实发育早期可能有高活性,而参与蔗糖降解的蔗糖转化酶、果糖激酶和己糖激酶可能在果实整个发育期都保持低活性。柠檬酸代谢相关基因分析发现,‘滑皮金柑’果肉中柠檬酸代谢上游丙酮酸激酶基因(sjg041680、sjg042420、sjg118500、sjg145340、sjg196000、sjg196980)、丙酮酸脱氢酶基因(sjg156830)、苹果酸脱氢酶基因(sjg084990、sjg039710)、苹果酸合酶基因(sjg264560)都在90 DAF有下调表达,而柠檬酸分解支路中唯一检测到的ATP-柠檬酸裂解酶基因(sjg127500)和磷酸烯醇丙酮酸羧激酶基因(sjg183420)都在150-210 DAF下调表达。说明ATP-柠檬酸裂解酶(ACL)途径可能是‘融安金柑’中后期酸降解的主要途径。3.对转录因子的分析表明:在‘滑皮金柑’中筛选到与蔗糖代谢相关的AP2-EREBP家族基因(sjg188780和sjg290640)分别在果皮和果肉90-210 DAF下调表达,同时b HLH家族基因(sjg021870)在果肉90-210 DAF下调表达。与柠檬酸代谢相关的b HLH家族基因(sjg156970)和WRKY家族基因(sjg084660)在果皮90-210DAF一致下调。而AP2-EREBP家族基因(sjg256130和sjg290640),b HLH家族基因(sjg317250、sjg021870)分别在果肉90-210DAF有一致上调或下调表达。尤其值得注意的是b HLH家族基因(sjg156970),其既与蔗糖代谢相关也与柠檬酸代谢相关,同时其在果皮果肉中的下调倍数分别达到42.81倍和18.21倍,可能是导致两品种糖酸代谢差异的关键调控基因。