连云港地区耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌的耐药和毒力相关基因分布特点及分子流行病学研究

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目的:碳青霉烯类抗生素被认为是治疗多重耐药菌感染的最后一道防线,但随着碳青霉烯类抗生素的大量使用,耐碳青霉烯的肺炎克雷伯菌日益增多,新的突变亚型不断被发现,严重威胁到全球人类的健康,给临床抗菌治疗带来极大的挑战。回顾性分析连云港地区2016年1月至2019年6月碳青霉烯类抗菌药物耐药的肺炎克雷伯菌,明确该地区的耐药基因的携带情况、毒力相关基因的分布特点以及分子流行病学特征,为耐药菌的监测和院感控制工作提供科学依据,对预防耐药菌的爆发流行的发生有一定的指引作用。方法:1、收集连云港市某医院2016年1月至2019年6月的非重复的CRKP菌株26例,所有菌株经VITEK2全自动微生物鉴定药敏分析仪鉴定,实验前经Bruker质谱仪重新鉴定,分析所有菌株的耐药情况及标本信息;2、采用PCR检测ESBLs耐药基因(blaCTX-M,blaSHV,blaTEM),碳青霉烯酶耐药基因(blaKPC,blaNDM,blaVIM,blaIMP,blaOXA-23,blaOXA-48),多粘菌素耐药基因(blaMcr-1);3、采用多重PCR检测Khe、Kphp、pilv、pill、ST23、ST65、ST86等基因,进行ST分型;4、采用多重PCR检测K1、K2等荚膜血清型及KL47、KL64这2个常见的ST11型菌株的荚膜合成位点;5、采用多重PCR检测毒力质粒相关的基因(rmpA、rmpA2、iroN、iutA);6、采用PFGE检测所有菌株,分析有无克隆传播;结果:1、26株菌株全部来自住院患者,其中以康复科为主,占58%。2017年1月至2019年6月,CRKP的平均检出率为13.1%。标本类型以痰液标本和尿液标本为主。药敏结果提示了所有菌株高水平耐药和多重耐药的特点。2、实验菌株碳青霉烯耐药基因携带情况:blaKPC基因73%,bla NDM基因8%,blaIMP基因 4%,bla VIM、bla OXA48、bla OXA23、bla Mcr-1 四种基因未检出。携带 bla CTX-M、bla TEM、bla SHV三种 ESBLs 耐药基因的比例分别为 65.4%、88.5%、100%,同时携带这三种耐药基因的比例为65.4%。3、第一体系ST分型结果:ST11为主,占73.1%,ST65占15.4%,而ST23、ST86、ST258 未检出。4、第二体系分型结果:荚膜血清分型检出wzyK1血清型7.7%,wzyK2未检出。所有ST11型菌株中,wzyKL64阳性率为84%,wzyKL47阳性率为为16%。5、第三体系毒力基因结果:rnpA、rmpA2、iroN、iutA等毒力基因阳性率分别为30.8%、30.8%、7.7%、38.5%,iutA阳性率最高。携带毒力质粒相关基因的ST11型CRKP检出8株,共有7株集中在康复科,7株中6株KL分型为KL64。6、PFGE结果:CRKP存在克隆性传播。结论:产碳青霉烯酶是连云港地区CRKP的最主要的耐药机制,该地区携带的耐药基因主要是blaKPC,主要的ST分型是ST11。康复科的CRKP检出率最多,检出率最高的ESBLs耐药基因类型是bla SHV。PFGE结果显示CRKP存在克隆性传播,检出8例携带毒力质粒相关基因的CRKP,其中7株集中在康复科,主要的KL分型是KL64,应引起相关科室和院感部门的重视。
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