HIV/AIDS肺脾气虚证的转录组学研究

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目的:应用mRNA芯片以HIV/AIDS肺脾气虚患者为研究对象,正常人为对照组,全血作为研究样品,检测HIV/AIDS肺脾气虚证和正常人体的差异性基因,分析其功能、信号通路及相互关系,并找出与证候的相关性。通过整合基因表达谱芯片信息,探讨相关mRNA分子功能,构建艾滋病肺脾气虚证基因分子网络。方法:病例来源于河南省的艾滋病肺脾气虚证患者和同地区的健康对照,应用博奥公司的DNA chips芯片,运用BRB-ArrayTools (Version4.1)软件对各种基因芯片数据进行处理,差异基因筛选应用单变量样品配对T检验,基因本体功能和信息通路分析,主要应用DAVID Tools(http://david.abcc.ncifcrf.gov/)在线分析,基因相互作用分析,主要应用STRING(http://string.embl.de)。结果:运用BRBArray Tools4.0软件对病人组和对照组的基因进行t检验,满足规定条件下,信号点有495个,其中上调调信号点有319个,下调的信号点有38个。上调基因的本体功能分析中,主要与蛋白质合成、分解、转运过程,离子通道,细胞核生成有关;下调基因本体功能分析中,主要与细胞凋亡,免疫应答和酶活性有关。上调基因信号通路中,主要与免疫应答和细胞凋亡有关;下调基因信号通路中T细胞、肿瘤坏死因子受体2和细胞感染有关。差异基因相互关系分析,上调基因共有150个基因相互紧密联系,组成了节点为150个,边为261的相互关系图。下调基因共有24个基因相互紧密联系,组成了节点为24个,边为71的相互关系图。聚类分析,基因表达谱可以把HIV/AIDS与健康人很好的分开。结论:1. HIV/AIDS肺脾气虚证与健康对照组具有各自的基因表达谱;2. HIV/AIDS肺脾气虚证的相关基因构成了其特有的分子网络;3. HIV/AIDS肺脾气虚证与许多和免疫、炎症反应相关的基因有密切关系。
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