随着知识经济的不断深化,自主创新已经成为推动经济健康发展和企业发展的重要途径。自主创新既是企业生存和发展的源动力,又是企业生存和发展的最终归宿,自主创新水平的高低日益成为影响企业竞争力的关键因素。而高新技术企业的发展状况以及自主创新能力水平,对于国家的经济社会发展具有基础性作用;高新技术企业不仅是国家经济社会发展的重要支柱,而且也是推动国家层面自主创新和技术进步的关键力量。基于此,测度和分析我国高新企业的自主创新能力,对于把握高新技术企业自主创新能力的水平,了解其制约自主创新能力的瓶颈因素,进一步探讨其发展路径具有较强强的指导意义。本文通过对国内外学者的研究成果进行分析和总结的基础上,以经济效益为主要标准重新界定了自主创新,并在此基础上重新界定了自主创新能力;从系统工程的角度建立了高新技术企业自主创新能力构成要素,论述了各要素之间的相互关系及主要衡量指标;本文构建了4个一级指标、14个二级指标、18个三级指标组成的高新技术企业自主创新能力测度模型;在比较分析了常用的测度方法和模型之后,选择AHP和FCE相结合的方法作为测度高新技术企业自主创新能力的方法;依据测度指标体系和测度方法,建立了高新技术企业自主创新能力的测度模型,并详细阐述了该方法的运算步骤;最后,本论文选取某高新技术企业进行实证分析和测度,验证了所构建的高新技术企业自主创新能力测度模型的可行性,并从高新技术企业自身能力建设出发提出了相应的对策和建议。