基于1,3,4-噁二唑硫醚结构系列探针的设计与合成

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水稻白叶枯病是一种世界性的农作物细菌病害,其病原菌为水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.Oryzae,Xoo)。由于近年来农作物病原菌的抗药性的逐年增加,用于防治该病的噻枯唑及其类似物等主要药剂的药效也明显下降。1,3,4-噁二唑类衍生物因其重要的生物活性不仅被广泛应用于医药领域,在农药领域也有一定的潜在应用前景。本课题组在前期和近期的工作中发现1,3,4-噁二唑硫醚结构化合物对水稻白叶枯菌有良好的抑制活性,然而该类化合物对水稻白叶枯病菌的作用靶标却是未知的。基于活性的蛋白质组分析(Activity-based protein profiling,ABPP)技术是寻找靶标、鉴定靶标身份和解析作用位点的重要工具,一般通过基于活性的小分子探针(Activity-based probes,ABPs)和基于亲和力的小分子探针(Affinity-based probes,AfBPs)寻找靶标,然后再结合蛋白质组学和质谱等方法对靶标身份进行鉴定。综上,本课题基于课题组前期研发的1,3,4-噁二唑硫醚类高活性化合物,设计并合成了两类小分子探针,并用相应探针进行了一系列的靶标鉴定实验。其中,探针1-3在引入光反应基团后,药物活性明显下降,且对Xoo的标记几乎没有选择性。在此基础上,进一步将母体结构进行修饰,设计并合成了另外三个小分子探针4-6以及一个阴性对照探针NP2。对Xoo的生物活性测试结果表明,探针4保持了与原药相当的生物活性,这就具备了作为ABP的基本条件。后续的探针初筛,浓度依赖性实验,阴性对照实验和竞争性抑制实验结果都表明了,50 kDa左右的蛋白是该类化合物与Xoo相互作用的特异性靶蛋白。Pull-down(拉下实验)和质谱鉴定结果表明了,延伸因子Tu是探针4的潜在作用靶标。
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