论文部分内容阅读
大蹄蝠(Hipposideros armiger)属翼手目(Chiroptera)蹄蝠科(Hipposideridae)蹄蝠属(Hipposideros),主要分布于我国南部和东南部,现已被世界自然保护联盟IUCN(2003)、IUCN/SSC Action Plan(2001)列为低危(Lc)种。目前,有关大蹄蝠分子生物学以及遗传背景等方面的研究尚很缺乏,为此本论文利用线粒体DNA控制区作为分子标记,对大蹄蝠线粒体DNA控制区序列变异特征及遗传多样性进行了研究。于2005年7月至2006年8月期间,分别从江西井冈山、重庆开县、云南昆明三地采集19只大蹄蝠个体,并从其翼膜和肌肉组织中提取全基因组DNA,利用PCR和DNA直接测序技术获得大蹄蝠线粒体DNA控制区序列,应用MEGA、DnaSP等生物信息学软件对序列进行分析。主要研究结果如下: 1.在19只大蹄蝠个体mtDNA控制区5端序列(852-862 bp)中共检测到63个核苷酸多态位点,其中简约信息位点41个。变异位点在控制区的3个区域中所占的比例分别为7.5％(ETAS区),2.1％(CD区)和11.7％(CSB区),变异主要发生在ETAS区、CSB区。 2.江西(JX)、重庆(CQ)、云南(YN)3个地理单元共定义15种单倍型,各地理单元之间无共享单倍型,不同地理来源个体在系统发生树上显示出显著的地域性分布格局(JX5例外)。各单倍型间序列分歧从0.2％-5.4％(平均为2.6％),群体内平均遗传距离变化范围0.2％-1.4％,小于群体间遗传距离变化范围2.7％-3.7％。 3.与其他濒危蝙蝠相比,大蹄蝠有着相对较高的遗传多样性,其核苷酸多样性(π)和单倍型多样性(H)分别为2.22±0.16％、0.9590±0.0360。两两群体之间遗传分化水平显著(p＜0.001),大蹄蝠整个种群存在显著的遗传分化(Fst＝0.7305,p＜0.001)。AMOVA分子变异分析表明:遗传变异主要发生在地理种群间占73.53％,而地理种群内只有26.47％。