企业孵化器在降低创业者的创业风险和创业成本，提高高新技术新创企业成功率，促进科技成果转化，帮助和支持科技型中小企业成长与发展，培养成功的企业和企业家，增加就业以及促进地方经济发展方面发挥着重要作用。因此，结合我国实际情况研究企业孵化器运行绩效，有针对性的提出促进企业孵化器发展的对策和建议，是企业孵化器研究的重要课题。　　 本文在简述我国企业孵化器的发展历程、存在形式及发展现状的基础上，研究了企业孵化器运行绩效评价的理论基础，探讨了经济增长理论、产业集群理论、企业成长理论、人力技能理论、知识经济理论对企业孵化器运行绩效评价的现实意义；接着利用因子分析与主成分分析法、层次分析法筛选企业孵化器运行绩效评价的影响因素指标并分析了约束条件，构建了企业孵化器运行绩效评价的影响因素及约束条件模型，并以我国168家国家级企业孵化器为样本，对我国企业孵化器的运行绩效进行了实证研究；研究结果显示，企业孵化器的人才结构与企业孵化器运行绩效之间呈现正相关关系，场地面积与工作人员数与企业孵化器的正相关主要来自于规模效应，此外广泛的融资渠道、针对性的扶持政策、成熟的创业型公共服务平台的建立及“鼓励创业、宽容失败”的创业氛围有助于提高企业孵化器的运行绩效；最后结合实证分析的结果，探讨了现阶段我国企业孵化器发展中存在的问题及其成因，提出了进一步促进企业孵化器发展的对策建议。