牡丹(Paeonia suffruticosa Andr.)是世界著名花卉之一。长期以来,牡丹的品种改良和育种工作一直是牡丹科研和生产的主要内容,远缘杂交育种是目前及今后相当长的一段时间内牡丹育种的主要方式,而亲和性较强的杂交亲本是牡丹远缘杂交成功的关键因素。本研究从丰富的种质资源中,选择性状优良的亲本材料,进行杂交试验,并对部分疑似杂种利用AFLP分子标记技术进行杂种鉴定,选择出亲和性较高的杂交组合,为探索克服牡丹远缘杂交的不亲和性的有效途径提供依据,同时获得一批牡丹远缘杂种材料为实现延长花期、一年多次开花以及丰富花色等品种改良目标奠定基础。主要结论如下:1、对14个牡丹种和品种、4个芍药种和品种及7个Itoh品种进行了远缘杂交的初步研究,共尝试了48个杂交组合,进行杂交1084朵花,得到1715粒种子,其中发芽534粒。发现杂交组合对远缘杂交结实率有很大影响,紫斑牡丹ב正午’与杨山牡丹‘凤丹白’ב正午’这两种杂交组合结实率高,能够较好打破牡丹组亚组间的远缘杂交不亲和;以芍药1#、2#和川赤芍作为母本,‘Golden Era’、‘金阁’、‘Renown’和‘Viking Full Moon’作为父本结实率较高,能够较好打破芍药组与牡丹组间的远缘杂交不亲和。2、对以紫斑牡丹不同无性系为母本,‘正午’为父本杂交所得子代中,选取22个杂交子代使用AFLP分子标记技术进行杂种鉴定,根据条带统计结果及聚类分析发现多数子代确实是紫斑牡丹与‘正午’的杂交后代,而且属于偏母本类型的杂种。子代AFLP扩增结果出现了父母本都不具有的谱带,说明子代不仅遗传了亲本的特征还产生了变异。3、紫斑牡丹ב正午’这一杂交组合亲和性较高,经杂种鉴定证明多数子代为真杂种,说明这一杂交组合具有较大的潜力,应该在今后的育种工作中得到进一步推广利用。