【摘 要】
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丙型肝炎病毒为单股正链RNA病毒,基因组全长约9.4kb。丙型肝炎进展迅速且后果严重,极易转变为肝硬化和肝癌,是危害人类健康的重要传染病之一。HCV分为6个基因型,各型的地域分
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丙型肝炎病毒为单股正链RNA病毒,基因组全长约9.4kb。丙型肝炎进展迅速且后果严重,极易转变为肝硬化和肝癌,是危害人类健康的重要传染病之一。HCV分为6个基因型,各型的地域分布,疾病表现以及对干扰素的治疗反应有很大差别,对HCV基因型及致病相关基因的结构和功能的差别研究有助于判断疾病的预后以及选择合适的治疗方案。本研究旨在了解福建地区HCV基因型,并对Core蛋白(HCV最重要的致病蛋白之一)进行氨基酸差异分析。本研究的第一部分为:巢式RT-PCR扩增血清样品HCV core基因部分区段(-12nt― +343nt),克隆并测序;以Clustalw软件对所克隆片段进行系统进化树分析并分型,了解福建地区的HCV基因型分布。结果表明在102份福建地区HCV抗体阳性血清中,HCV检出率为41.2%(共42份),系统进化树分析提示共有1b、2a、3b、6a四个不同的基因型,以6a和1b基因型为主。本研究的第二部分为:RT-PCR扩增并克隆上述四个基因型的HCV全长core基因并比较各基因型Core蛋白的氨基酸差别。结果显示各型HCV Core蛋白共有33个氨基酸差别,主要集中4aa-21aa,68aa-78aa,106aa-121aa,139aa-163aa,182aa-191aa五个区域,不同基因型HCV在这些区域氨基酸的差别可能会导致Core蛋白的功能差异并影响其致病性。
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