聚酮类抗生素是由链霉菌生产的自然界中很重要的一类抗生素。在它的合成和释放的过程中,硫酯酶发挥着重要的作用。它不仅能够有效的催化抗生素产物的水解,同时还能够校正抗生素碳链延伸中发生的错误,确保抗生素的产量。本文针对从NCBI数据库中搜索到的链霉菌中的硫酯酶氨基酸序列,利用邻接法和最大似然法对TE进行了系统发育分析,建立了链霉菌硫酯酶的进化发育树,结果表明,链霉菌硫酯酶从氨基酸序列上可以分为三大类。另外,从构建的系统发育树中发现,链霉菌中存在一种acyl-CoA TEⅡ,该类酶仅存在于五种链霉菌中。经过多种序列分析手段和结构分析发现,这些acyl-CoA TEⅡ同真核生物TesB家族的acyl-CoA TEⅡ在序列和拓扑结构上都具有很高的保守性,并且在催化活性位点上完全保守。因此推测它们属于TesB家族,并根据它们在PKS基因簇中的位置推测其功能为校正酶。通过PDB结构数据库中不同pH值条件下苦霉素合成基因簇(PICS)TE和红霉素合成基因簇(DEBS)TE的拓扑结构发现,pH值对这两种酶的结构有不同的影响。利用计算机模拟软件Sybyl6.92进行分子模拟计算,将不同pH值的蛋白同底物进行对接,通过考察软件打分函数的结果和底物构象发现,PICS TE的活性随pH值的升高而增强,而DEBS TE在pH值升高至8.5的时候完全失活。模拟结果从理论上证明了文献中的研究结果,不同硫酯酶在同一pH值条件下的活性是不同的,因此在聚酮类抗生素组合生物学的研究中需要注意pH对不同菌种的硫酯酶活力的影响。