国库集中支付源于2001年国家提出的《财政国库管理制度改革试点方案》，2002年教育部选取了5所部属高校作为试点高校，2005年浙江省提出《浙江省财政国库管理制度改革方案》，2007年浙江省高校开始启用国库集中支付。因高校的的资金来源主要来自政府财政资金的拨款，从资金层面上来说应纳入实施国库集中支付制度。　　第一部分主要介绍了本文的研究背景、研究意义和国内外研究现状、研究的内容和方法。讲述了国库集中支付制度是因财政国库改革需要而推行，旨在从源头上显著提升资金运营效益；能够加强资金管理的计划性；规范缴拨资金的程序，明确资金拨付的方式，增强资金的预算执行透明度。　　第二部分是对国库支付和高校财务管理的核心概念及理论基础进行阐述。国库集中支付就是改变现行财政资金拨付方式，由财政部门通过国库单一账户体系，将资金支付到收款单位。高校的财务主要是预算管理，高校要严格按照预算管理办法进行预算编制，待财政部门批复后，严格执行预算安排进行资金使用。采用的三种理论为公共财政理论、委托代理理论、公共选择理论。　　第三部分是介绍国库支付制度在高校的实施情况进行分析，也对高校实行国库集中制度的由来和内容进行了阐述，推行国库集中支付制度后高校财务管理中的变化：财政资金拨付方式的变化、财政资金支付方式的变化、财务信息管理系统的变化。　　第四部分是高校实行国库支付后产生的问题进行分析。高校在适用国库集中支付制度三个层面的问题，认知层面有对高校的特殊性认识不足等、制度层面有缺乏相应制度等、操作层面有用款计划申报不合理等。　　第五部分是完善高校国库集中支付制度的对策。主要是在认知层面提出决策人员应充分调研高校体制上的特殊性、加强高校财务人员对国库集中支付制度的学习以及对高校教职工加强国库集中支付制度宣传和引导；在制度层面提出出台相应的国库集中支付规章制度、拓展高校资金自主权、完善会计核算体系；在操作层面提出增强用款计划性、深化高校预算编制、沟通财政出台相应办法、推进信息系统建设。