应用酵母双杂交系统初步筛选与SARS-CoV解旋酶相互作用的细胞蛋白

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SARS冠状病毒(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus,SARS-CoV)为正链RNA病毒,病毒解旋酶(Helicase,HEL)对SARS-CoV在宿主细胞内复制和增殖是必不可少的。HEL的部分生物学特性已有相关的研究报道,但维持HEL活性的细胞辅助因子、HEL是否具有致病作用等尚未有研究报道。为此,本研究拟采用酵母双杂交系统对大鼠肺上皮细胞文库进行筛选,以期获得与HEL相互作用的蛋白质信息,为研究HEL的作用机制提供线索。本研究第一部分旨在排除SARS-CoV HEL的自激活作用,为后续的酵母双杂交实验打下基础。为此,将pGBKT7-HEL(克隆有HEL基因的重组pGBKT7诱饵载体)转化酵母AH109细胞,首先以Western Blot检测融合蛋白,证实HEL蛋白可在AH109细胞中表达,随后通过滤纸法定性检测酵母胞内β半乳糖苷酶活性证明HEL蛋白无自激活作用。本研究第二部分将pGBKT7-HEL和来源于大鼠eDNA的猎物文库质粒顺序转化酵母AH109细胞,通过营养缺陷培养基进行阳性克隆的挑取。随后将顺序转化所得133个克隆通过三轮营养筛选、酶切鉴定、β-半乳糖苷酶活性检测、一对一酵母双杂交系统的回复性实验确认、测序验证筛除假阳性,最后用Blast软件进行同源性分析研究所筛到的相关蛋白质的信息。通过多重验证,最后确定7种相关蛋白,分别为Actn2(Actinin alpha 2)、Bcas2(Breast carcinoma amplified sequence 2)、Thap 11(Thr-His-Ala-Pro domain containing 11)、Ada(Adenosine deaminase)、Ddx5(Asp-Glu-Ala-Asp box polypeptide 5)、Dars2(Aspartyl- tRNA synthetase 2)及Smarcb 1(SWI/SNF related,matrix associated,actin dependent regulaor of chromatin,subfamily b,member 1)。总之,本研究初步确定7种与HEL相互作用的大鼠肺上皮细胞蛋白,但这些细胞蛋白的最终确认,以及它们与HEL的相互作用及机制均有待进一步研究。
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