传统理论认为，作物长期连作必然造成土壤养分失衡和肥力下降，土壤微生物多样性等土壤质量的重要指标下降，引起作物生长发育缓慢，产量、品质降低等不良结果。新疆是我国最重要的棉花产区，棉花长期连作现象严重，但全疆棉花平均单产水平却逐年增加，同时棉花生长势差、病虫为害重、植棉成本高、经济效益低的棉田也在逐渐增多。这是否是长期连作导致棉田土壤生态环境变化、进而影响棉花的生长；耕作措施是如何调节棉田生态环境的变化。本文从土壤微生物多样性变化的角度，研究棉花不同连作年限条件下和长期连作出现障碍后采取水旱轮作和深翻等耕作措施对土壤细菌群落多样性、微生物量和酶活性的影响，探讨长期连作对棉田土壤微生物多样性的影响及耕作措施的调节效应，为新疆棉区维持棉田高产、高效的土壤可持续生产能力提供依据。主要研究内容如下： ⑴土壤细菌群落多样性的变化。随连作年限的延长，棉田土壤细菌丰富度和群落多样性呈递增的趋势。与连作30年的障碍棉田相比，水旱轮作0～40cm、深翻后20～40cm土层的土壤细菌丰富度和群落多样性升高。数学平均未加权成对聚类分析（UPGMA）表明，连作20年和30年的棉田聚为一类，而连作5年棉田与种植1年的棉田聚为一类，短期连作对细菌群落结构影响不明显，连作20年以上细菌群落结构发生了显著的变化。 ⑵土壤微生物量的变化。随着连作年限的延长，土壤微生物量碳、氮含量和土壤微生物量碳/氮高于种植1年的棉田，土壤微生物商呈递减的趋势。与连作30年的障碍棉田相比，进行水旱轮作后棉田的土壤微生物量碳、氮含量明显升高，微生物量碳/氮下降，微生物商升高；采取深翻措施的棉田土壤微生物量碳、氮含量在20～40cm土层明显升高，微生物量碳/氮下降，微生物商下降。 ⑶土壤酶活性的变化。与种植1年的棉田相比，多年连作棉田土壤脲酶、蔗糖酶、磷酸酶、蛋白酶和脱氢酶活性均有所增加。与连作30年的障碍棉田相比，深翻和水旱轮作棉田的土壤脲酶、蔗糖酶、蛋白酶和脱氢酶活性升高。 ⑷土壤细菌群落多样性、微生物量和酶活性间的关系。衡量土壤微生物多样性的shannon指数、微生物量和酶活性之间均呈显著或极显著正相关关系；土壤有机碳与shannon指数、微生物量碳和微生物量氮以及活性均达显著或极显著正相关；土壤细菌群落多样性、微生物量和酶活性随连作年限的延长呈增加趋势主要是由于土壤有机碳的增加。