RNA编辑是通过对m RNA上的特定位置进行碱基的替换、插入或删除导致DNA所编码的遗传信息发生改变的过程。RNA编辑广泛存在于动植物中,有效扩大了遗传信息使生物更好地适应生存环境。RNA编辑蛋白主要通过对底物RNA的位点特异性脱氨基作用完成特定碱基转换。对RNA编辑蛋白结构与功能关系的认识将有助于理解RNA编辑过程,并为设计识别特定序列RNA的人工编辑蛋白提供参考。PPR蛋白是在真核生物中广泛分布的一类RNA编辑蛋白。其中,在植物线粒体与叶绿体中主要的RNA编辑蛋白类型是DYW亚子类。目前,由于野生型PPR蛋白的纯化存在较大困难,因此PPR蛋白与RNA底物的互作机理尚不清晰。已有的工作集中于N端PPR模体的识别功能研究,而C端结构中除DYW结构具有脱氨酶类似结构外,E,E+结构的功能尚不明确。本课题以DYW亚子类的两个RNA编辑蛋白OTP82和CRR22为研究对象,通过建立OTP82和CRR22 C端片段的原核表达系统,完成OTP82和CRR22 C端片段的体外纯化,并利用凝胶迟滞电泳的方法比较OTP82和CRR22 C端蛋白片段在底物相互作用中的差异,进而推测PPR DYW亚子类的RNA编辑蛋白的C端结构的可能作用机制。此外,课题完成野生型OTP82的体外表达条件的摸索,为获得高纯度全长PPR蛋白提供基础实验数据。通过本课题的研究得到以下结论:（1）同一亚类的OTP82与CRR22的C端结构E+DYW在底物识别中的作用机制存在较大的差别。前者具有选择性识别底物构象的能力,参与底物RNA的结合;后者不与底物RNA结合,更倾向参与形成蛋白二聚体。（2）野生型OTP82具有13个PPR模体,全长蛋白共823个氨基酸,原核表达产物为包涵体形式,经过变复性条件优化可以获得一定量野生型OTP82。本课题研究为揭示RNA编辑蛋白作用机制提供基础实验依据,为后续利用PPR蛋白进行工程蛋白设计奠定了基础。