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高保真DNA聚合酶由聚合中心和酶切中心组成,聚合中心负责DNA聚合作用;而酶切中心负责发挥其3′→5′外切酶功能,对掺入的不配对碱基予以切除,以保证PCR产物的模板依赖性。由不能及时纠正或难于纠正的错配碱基引发的“关”闭DNA聚合反应,同样保证了DNA聚合反应成熟性终产物的保真度。而含有耐外切酶消化的硫代磷酸修饰的错配引物不能被3′→5′外切酶及时校正其错配碱基,导致了DNA聚合反应的非成熟性终止,从而构成了对SNP具有高度辨认能力的SNP敏感性复合分子“开/关”系统。这一机制在很大程度上满足了后基因时代对SNP分析的要求。 目的:探索高保真DNA聚合酶介导的SNP敏感性复合分子“开/关”在应用过程中的样品浓度检测范围、引物3′端硫代磷酸修饰个数和高保真酶活性三个条件,从而确定利用DNA聚合酶高保真原理检测SNP的最适条件,为SNP的检测提供新途径。 方法:以质粒pDC316为样品,通过设计3′端与模板配对或不配对的硫代磷酸修饰引物,从样品浓度、引物3′端硫代磷酸修饰个数和高保真酶活性三个方面检测SNP敏感性复合分子“开/关”的准确性,分析出最适合的实验条件。 结果:研究中发现Pfu酶的“开/关”效应在引物3′端作一个硫代磷酸修饰时,仅在样品浓度为2ng/100μl或以下时能准确“关”闭含错配碱基的PCR反应;在引物3′端作两个硫代磷酸修饰时,在实验预设的样品浓度范围100-1ng/100μl内,都能准确“关”闭含错配碱基的PCR反应;在引物3′端作三个硫代磷酸修饰时,“开/关”效应出现假阴性结果。 Pyrobest酶介导的“开/关”效应在引物3′端作一个硫代磷酸修饰时不能准确“关”闭含错配碱基的PCR反应;在引物3′端作两个和三个硫代磷酸修饰时,均在样品浓度为10ng/100μl或以下时能准确“关”闭含错配碱基的PCR反应。 Deep Vent酶介导的“开/关”效应在引物3′端作一个和两个硫代磷酸修饰时都不能准确“关”闭含错配碱基的PCR反应;在引物3′端作三个硫代磷酸修