艰难梭菌耐药现状及其对利福霉素耐药机制研究

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目的:艰难梭菌是一种革兰阳性,可形成芽胞,可产生毒素的厌氧杆菌,是卫生保健相关性感染最常见的病原菌,也是社区感染的重要病原菌。抗菌药物的使用,会导致肠道微生物群结构紊乱,艰难梭菌增殖并定植于结肠,产生毒素,引起感染。艰难梭菌感染的症状主要表现为发热和腹泻,严重者可有伪膜性肠炎、中毒性巨结肠、肠穿孔的临床表现,甚至导致死亡。大量流行病学研究显示,艰难梭菌感染在世界范围内的的发病率及其给卫生保健系统造成的经济负担在近20年急剧增加,主要和毒力较强的BI/NAP1/027型艰难梭菌出现相关。对多种抗菌药物耐药,在艰难梭菌的传播和流行方面发挥关键作用。遗传学分析发现艰难梭菌的基因组决定了其有多种耐药机制,包括存在于染色体或可移动遗传原件中的耐药基因、基因突变导致抗菌药物作用靶位或药物代谢通路改变及生物膜形成等。另外,可能存在多种复杂的耐药机制介导的抗菌药物耐药。本研究拟在以往研究基础之上,对石家庄地区艰难梭菌的抗菌药物敏感性特征及耐药机制深入探究。方法:自河北省医学菌种保藏中心选取200株艰难梭菌,经基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪和16S rRNA基因同源性分析进行鉴定。通过聚合酶链式反应检测艰难梭菌毒素及二元毒素基因携带情况,并分析其核糖体型别。采用琼脂稀释法检测艰难梭菌对非达霉素、甲硝唑及万古霉素等14种抗菌药物的敏感性。本研究尝试运用生物信息学方法,进一步探究艰难梭菌对利福霉素类抗菌药物敏感性降低的蛋白质结构基础。结果:本研究选取菌株全部为产毒型艰难梭菌,共包含46个核糖体型,RT012、RT 001、HB 024及RT 017是四个主要流行型别,共占比48.50%。艰难梭菌对环丙沙星、克林霉素、红霉素和四环素的耐药率高于30.00%,对利福昔明、左氧氟沙星、头孢曲松、替加环素、利福平和氯霉素的耐药率低于20.00%,全部菌株对美罗培南、非达霉素、甲硝唑和万古霉素均敏感,被检测菌株的多重耐药率高达68.50%。通过对RNA聚合酶β亚基基因中利福霉素耐药决定区测序,发现Asp492Tyr、His502Asn、His502Tyr、His502Asp和Arg505Lys突变与艰难梭菌对利福霉素敏感性降低相关。通过蛋白质结构模拟及分子对接,进一步证明,利福霉素与艰难梭菌突变型RNA聚合酶β亚基亲和力降低。结论:本研究发现,艰难梭菌对用于艰难梭菌感染治疗的非达霉素、甲硝唑和万古霉素敏感性较高,但对环丙沙星、克林霉素、红霉素和四环素有较高的耐药性,应当引起重视;利福霉素与其靶蛋白质亲和力降低可能是艰难梭菌对利福霉素类抗菌药物的敏感性降低的原因。
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