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目的:
1.通过对褪黑素通路相关的候选基因上的SNPs的筛查,明确候选基因与AIS之间的关系;
2.通过对SNPs基因型与AIS临床表型的关联分析,寻找可能潜在的致病基因,从遗传学上丰富PUMC等临床表型的内容。
3.进行流行病学调查,筛查是否存在与SNPs有交互影响的危险因素。
4.通过基因水平的研究,明确褪黑素与AIS之间的关系。
研究方法:
根据AIS病因学研究现状,我们选择褪黑素通路作为研究对象,选择与褪黑素和5-HT作用相关的受体基因(MTNR-1B基因、HTR1A基因和HTR1B基因),以及褪黑素合成通路上的限速酶基因(AA-NAT基因和TPH1基因)为候选基因。以SNPs(22个)为遗传标记,通过基因测序的方法,在103名AIS患者(23名男孩,80名女孩,平均年龄15.18岁)和108名对照(27名男孩,81名女孩,平均年龄15.58岁)中对这些候选基因进行筛查。将筛查结果中具有多态性的SNPs的数据,进行基于单位点的关联分析、临床表型与SNPs的关联分析和基于多位点的单倍体分析。
研究结果:
1.MTNR-1B基因的rs8192552,HTR1A基因的rsl800043,AA-NAT基因的rs2071031、rs28697191、rs35065674、rs34753 195、rs8073245和rs8071747,及TPH1基因的rs1134530、rs34396122、rs41274348和rs41274350等共12个SNP位点无多态性。
2.在基于等位基因和基于基因型的“病例-对照”关联分析中,均筛到阳性位点rs10488682(TPH1基因)(P<0.05)。
3.在基因型与临床表型(性别、PUMC分型和Cobb角)的关联分析中,没有发现阳性位点。 4.在多位点单倍体分析中,发现5个阳性单倍体(P<0.05):rs423 8989G-rs3760138T和rs2893 6679G-rs423 8989G-rs3760138T(AA-NAT基因),rsl0488682A.rs8176799A、rs10488682T-rs8176799A和rs10488682A-rs2108977T(TPH1基因)。
结论:
1.rs8192552(MTNR-1B基因)没有多态性,可能在汉族人口中是保守的,与国外报道有种族差异。
2.当rs10488682位点(TPH1基因)为A/T杂合型时,AIS的易感性升高,提示TPHl基因可能是AIS的易感基因。
3.AA-NAT基因有两种单倍体与AIS的易感性升高相关,提示AA-NAT基因可能是AIS的易感基因。
4.褪黑素合成通路中两个限速酶基因(TPH1基因和AA-NAT基因)均与AIS的易感性升高相关,提示褪黑素合成通路上的代谢酶在基因水平的异常所导致的褪黑素合成障碍,可能与AIS的发生密切相关。