增龄恒河猴外周血白细胞中的microRNA转录组分析

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liyanfeiwoshi
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背景人口老龄化已成为一个严峻的的社会性问题,预计到2050年,世界老年人口将与青年人口持平。所以对于衰老研究就显得很重要。而microRNA作为一类具有调控功能的小RNA在衰老研究中有着不可忽视的地位。我们的研究目的在于寻找恒河猴在增龄过程中涉及到的衰老和长寿相关的差异miRNA,旨在为筛选出在外周血白细胞中可以作为衰老标志物的miRNA,为人类新的衰老标志物的发现提供参考。方法我们根据恒河猴的年龄和性别将其分为四个不同年龄段的雌雄组,共有8个组,分别为幼儿组(2Y-F/M)、成年组(5Y-F/M)、老年组(11Y-F/M)和长寿组(20Y-F/M)。采集了 282只在圈养情况下自然生长的不同性别的恒河猴外周血,提取了血液白细胞中的RNA。样品分组混合,RNA质量符合第二代测序要求。测序下机后我们主要利用了生物信息学手段将8个组别的miRNA数据按性别差异,性成熟发育,衰老过程和长寿四个方面进行miRNA的差异分析筛选和功能富集。之后我们选取了其中一部分有文献支撑的与衰老相关的差异miRNA进行real-time PCR验证。选取了其中最有代表性的miR-16-5p进行了下游靶基因的预测和real-time PCR检测。结果我们针对增龄恒河猴外周血白细胞的miRNA分析中发现,同时参与了性别差异和增龄的过程的miRNA共有65条。在仅针对恒河猴性别差异的miRNA筛选中我们发现mml-miR-409-3p对于性别的影响贯穿于整个增龄过程。在仅针对增龄阶段的分析中发现:mml-miR-371-5p和mml-miR-1-3p则分别与雌性和雄性恒河猴的性成熟过程相关。在衰老进程中,mml-miR-17-5p在老年组(11Y)中表达量升高,而mml-miR-372-3p则相反,同时mml-miR-15b-3p参与了从幼儿期发展为老年期的整个过程。在关于长寿相关的miRNA分析中可以得到22条与长寿相关的miRNA,其中let-7b-5p仅在雌性恒河猴中起作用,且在长寿组中其表达量下降。我们还筛选到了随年龄持续变化的microRNA:miR-135a-5p,miR-144,miR-339-5p,miR-155,miR-151-3p,miR-140-5p,miR-146a-5p,miR-126,miR-16。对 miR-16的验证中发现了 miR-16可能是通过抑制胰岛素信号通路来影响衰老进程的。结论我们筛选到的这些与增龄恒河猴自然衰老生理过程相关miRNA可以作为将来在人类外周血中寻找非编码RNA的衰老标志物提供基础参考数据。
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