本研究旨在研究山羊IDO1和MPO基因受到正选择的单核苷酸多态性位点(SingleNucleotidePolymorphism，SNP)。在研究中，我们通过测定脱氧核糖核酸序列的方法得到了106只山羊中IDO1基因的多态性，最终在IDO1序列的外显子2-3和外显子10区域中共得到了5个突变位点。随后对IDO1基因外显子2-3(G290A;T309C)和外显子10(G290A;T309C)的进行基因分型，并通过聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction，PCR)检测多态性位点。我们在MPO基因的外显子3-4中发现了一些突变，但是并未导致氨基酸变化。由于密码子的简并性，这些突变并未改变编码蛋白的氨基酸序列，最终成为对机体没有影响的沉默突变。　　系统发生分析表明，山羊IDO1和MPO基因与绵羊具有最高的相似性，高达98％和99％，与此同时山羊MPO基因与斑马鱼和小鼠仅有72％和83％的相似性。通过似然比检验，在使用朴素贝叶斯方法(NaiveEmpiricalBayes，NEB)分析正选择M8位点时候发现，IDO1和MPO表现出了较为丰富的参数信息。结果显示IDO1基因中有10个位点受到正选择（IDO1的LRTs分别为3.184和18.858，MPO为33.124）。这些位点包括350R、371N、398L、400T、302E、435T、231K、213I、210Y、18T(P＞0.95);MPO有五个位点51E、652E(P＞0.95)、325S、742S、765G(P＞0.99)。由于只有大约15％的褪黑素是通过这条通路被分解的并且在这个通路中的相同位点上，这两个基因承担的任务相同。因此，我们推测IDO1和MPO基因在进化过程中受到正选择驱动。