广西地区帕金森病PINK1基因突变与多态性的研究

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目的:探讨广西地区帕金森病(Parkinson Disease,PD)患者PINK1{Pho- snhatase and tensinhomologue (PTEN)-induced kinase 1}基因1-8号外显子点突变、缺失突变和多态性分布特点,及其与帕金森病的关系。方法:采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)扩增50例帕金森病组(其中早发性帕金森病28例、晚发性帕金森病22例)和55例相匹配的对照组(其中青年对照组17例、老年对照组38例)的PINK1基因1-8号外显子;用琼脂糖凝胶电泳(agarose gel electrophoresis,AGE)检测PCR产物是否为特异性扩增和PINK1基因1-8号外显子的大片段缺失突变;单链构象多态性分析(single strand conformation polymer phi- sm,SSCP)检测PINK1基因1-8号外显子的点突变,并对SSCP出现异常泳带的相应片断进行DNA直接测序,如果发现多态性位点,采用斑点杂交法进行检测进一步明确其基因型,并计算多态性位点的基因型频率和等位基因频率,所有实验结果采用卡方检验进行统计分析。结果:未发现帕金森病组和对照组出现PINK1基因外显子的大片段的缺失突变;在早发性PD组中有1例出现5号外显子杂合型突变(G12169A),导致第341位氨基酸的甲硫氨酸被异亮氨酸所替换(M341I);并发现广西地区存在PINK1基因5号外显子G12164A、内含子上游调控区IVS5-5G-A(即G12101A)连锁多态。此多态位点为已知的单核苷酸多态,但未见报道它们呈连锁状态。G12164A多态有G/G和G/A两种基因型,无A/A基因型,而IVS5-5G-A(G12101A)多态有G/A和A/A两种基因型,无G/G基因型。G12164A多态导致第340位氨基酸上的丙氨酸被苏氨酸所替(A340T),其生物学意义还不清楚。生物信息学分析发现内含子上游调控区ⅣS5-5G-A(G12101A)多态位点位于第五外显子mRNA剪接受点区域内,极可能破坏基因表达的正常调控,从而影响PINK1蛋白的翻译导致PINK1蛋白功能的异常或丧失。帕金森病组的PINK1基因5号外显子G12164A、内含子上游调控区IVS5-5G-A(G12101A)连锁多态在G/A、A/A基因型频率(42%)与对照组(23.6%)相比有升高趋势(X2=4.034,P=0.045),在晚发性PD组中G/A、A/A基因型频率(45.5%)与老年对照组(21.1%)相比有升高趋势(X2=3.951,P=0.047),以上差异均有统计学意义,余各组之间的等位基因频率比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:PINK1基因可能不是广西地区PD患者致病基因的突变热点;G121- 64A、IVS5-5G-A(G12101A)连锁多态可能是广西地区晚发性PD患者的易感因素。
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