基于iTRAQ技术的SD大鼠弥漫性轴索损伤的蛋白质组学研究

来源 :重庆医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:carjitar
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目的本课题通过建立SD大鼠DAI动物模型,探讨基于i TRAQ结合LC/MS/MS技术应用于SD大鼠DAI后脑组织及血浆的蛋白质组学研究的可行性;同时,筛选出显著差异表达的蛋白质,为进一步研究DAI后轴索损伤的病理生理机制、DAI的早期诊断、药物治疗靶点的确定、法医临床学及法医病理学的鉴定提供有意义的实验数据。方法采用改良的Marmarou A法建立SD大鼠DAI模型,将实验动物分为8组(空白对照组、假打击组、打击死亡组、致伤1 h组、致伤6 h组、致伤1 d组、致伤3 d组、致伤7 d组),提取各组大鼠脑组织进行HE染色及嗜银染色,验证DAI模型建立成功;同时,提取各组SD大鼠心血;运用iTRAQ结合LC/MS/MS技术研究SD大鼠DAI后脑组织及血浆差异蛋白质表达,并通过生物信息学技术分析,筛选、验证及鉴定出DAI特异性蛋白质生物标志物。结果1858种蛋白质在大鼠DAI后脑组织中被定性、定量检测出;生物信息学分析结果表明,所定量检测出的1858种蛋白质在细胞中分布广泛、功能多样,并且参与了多种生物过程;10种蛋白质在大鼠DAI后脑组织中显著差异表达,包括2种表达上调的蛋白质和8种下调的蛋白质;Western blot及免疫组织化学方法检测所筛选的差异表达的蛋白质,结果显示,4种蛋白质(突触相关蛋白25、柠檬酸合成酶、Rho相关蛋白激酶2和微管相关蛋白1b)在大鼠DAI后脑组织中显著性差异表达。同时,374种蛋白质在大鼠DAI后血浆中被定性、定量检测出,其中57种蛋白质至少在1个时间点显著性差异表达。生物信息学分析及Western blot方法检测结果显示,血红素结合蛋白及3-磷酸甘油醛脱氢酶在SD大鼠DAI后血浆中显著性差异表达,有望成为DAI潜在的早期生物标志物。结论iTRAQ技术是研究DAI蛋白质组学的有效技术手段。SD大鼠DAI后脑组织及血浆蛋白质存在明显差异性表达,为进一步探索DAI后轴索损伤的病理生理机制、临床药物治疗靶点的确定提供了帮助;同时,筛选出的特异性强的血浆蛋白质,为DAI的早期诊断、法医临床学及法医病理学鉴定提供有意义的实验数据。
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