随着京郊农村城市化进程日益加快，昌平区城乡结合部的农村土地不断被征占，城乡结合部失地农民数量不断增加。如何做好这些地区失地农民的就业及社会保障工作，维护农村社会稳定，成为当地政府的一项重要工作。为此，昌平区开展了农村集体经济产权制度改革工作，使农村集体经济组织的资产转变为股权，让农民当上股东，实现农村集体经济发展与农民增收紧密结合，保障了失地农民的生活来源。通过不断的摸索，昌平区在农村集体经济产权制度改革工作中不断创新，结合每个改革试点村的实际情况，制定了完整的农村集体经济组织改革工作程序，研究出了不同的股份量化模式和村股份经济合作社董事会、监事会选举模式，最大限度地保护了农民利益，维护了股东权益。但是，完成农村集体经济产权制度改革的村集体经济组织的运营工作并不是一帆风顺，出现了一些影响村集体经济组织长久健康发展的问题。针对这些问题，本文提出了相应的解决办法，以促进农村集体经济组织产权制度改革工作在城乡结合部地区顺利全面推开。