本文通过水族箱实验进行了罗非鱼、鲮鱼对浮游植物影响的研究，并通过比较调查研究了西湖浅水湖泊高等水生植物对浮游植物的影响。室内试验通过在水族箱内注入滤去浮游动物的暨南大学明湖湖水，分别放养罗非鱼、鲮鱼，与没有放养鱼的水族箱作对照，研究了微型生态系统中这两种鱼对浮游植物群落的不同影响。实验为期31天，定期检测了浮游植物状况和水质变化，并在实验结束时检测了水族箱内的附着藻，结果表明：浮游植物的种类、数量、生物量、群落结构、多样性等在各组中变化明显不同。放养鱼使浮游植物细胞密度、叶绿素、生物量均高于无鱼组，但鲮鱼组较罗非鱼组变化更显著，鲮鱼组的多样性也显著降低；实验结束时鲮鱼组的优势群落为绿藻门，罗非鱼组为硅藻门。产生不同结果的原因主要跟两种鱼营养盐释放和食性的不同有关。实验发现鲮鱼组叶绿素浓度与无机氮浓度、总磷浓度的变化有一定相关性(r=0.65，r=0.65)；对照组叶绿素浓度与总氮浓度、总磷浓度有很好的相关性(r=0.74，r=0.96)；罗非鱼组的却为负相关。结合各组附着藻的情况，以及每种鱼的食性，得出鲮鱼组的营养盐浓度对浮游植物起主要影响，而罗非鱼的摄食则对浮游植物生长产生更大的压力。这两种鱼会使浮游植物群落向不同的方向演替。在惠州西湖，以富营养化的平湖(藻型湖泊)和正通过水生植物进行生态治理的示范区(草型湖泊)为研究对象，从2006年4月到2007年3月进行了水文和浮游植物的监测，观察示范区与平湖浮游植物季节变化的不同。示范区一年间共监测到浮游植物七门130种，平湖有七门116种。平湖的浮游植物数量是示范区的30.8倍，生物量也远高于平湖；示范区的藻类生长高峰期在6-9月，而平湖则从6月持续到11月，在11月达到最高值。示范区全年无明显的绝对优势种，春夏季数量较多的有硅藻门的针杆藻，曲壳藻等，秋季隐藻门的卵形隐藻、啮蚀隐藻等数量较多，冬季以针杆藻、隐藻等共同占优势；而平湖常年以微小色球藻、银灰平裂藻占优势。水生植物通过改变水体的理化指标等影响浮游植物群落结构。