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猪圆环病毒病(Porcinecircovirusdiseases,PCVD)是由2型圆环病毒(porcinecircovirustype2,PCV2)引起猪的一种新发传染病,因猪群感染后可造成生长发育不良及全身广泛性的组织损伤而成为当今危害养猪业的重要疫病之一。近年来,该病已在新疆主要养猪地区流行,但对区域性猪群感染情况及流行毒株的分子特征尚不清楚,对其危害程度还缺乏足够认识。 本研究通过采用现场调查、血清学及分子流行病学等方法对北疆部分地区(石河子、五家渠、奎屯等)猪场猪2圆环病毒病进行调查,旨在摸清其流行现状、猪群感染率及感染特点、优势基因型等,为该病综合防制提供理论依据。结果如下: 1.血清流行病学调查结果显示,PCV2在猪群中的平均感染率为54.29%,石河子、五家渠、奎屯三个地区分别为64.14%,40.11%和59.07%,说明在这些猪群中PCV2的带毒率已经十分普遍。不同生长阶段的猪群感染情况分别为哺乳仔猪47.78%、断奶仔猪46.04%、育肥猪53.74%、母猪65.35%以及种公猪56.72%。 2.对研究所得的18株PCV2全基因组进行测序发现,主要以1767bp(14株)为主,但同时也出现了1766bp和1778bp的变异株。全基因组核苷酸相似性比较发现,本试验18株PCV2序列之间除141-ZF1、141-ZF2和141-ZF3三株与其他株之间相似性较低外,基因组差异并不显著(95.6%-100%);而与GenBank中登录的PCV2参考序列之间的核苷酸相似性为94.3%-99.9%,说明了新疆PCV2流行毒株的复杂性和多样性。 3.通过相似性比对及遗传进化分析,本试验中所得18株PCV2可分为两个大群,其中134-ZF1、134-ZF2、134-ZF3、141-ZF1、141-ZF2、141-ZF3、142-TL1、142-TL2、142-TL3、142-TL4、142-TL5和148-ZF3这12株属于PCV2b亚型(检测株1群),占到了66.7%,而133-ZF1、143-2-15、148-ZF1、WJQ001、KT001和KT02这6株属于PCV2d亚型(检测株2群),这一结果也与国内近年来PCV2分离株基因型基本一致,说明PCV2b亚型为该地区PCV2流行毒株的优势基因型。 4.本试验中18个检测株ORF2的氨基酸序列发现多处变异,尤其是在48-95aa、131-138aa、186-218aa上。这些部位氨基酸残基的变异是否会影响其Cap的作用,以及PCV2致病性是否会发生改变还有待进一步研究。此外,本研究中18株PCV2毒株在第59-80位和第121-136位这两个与免疫反应相关的主要区域的氨基酸均发生了不同程度的变异,这是否是由于在免疫压力之下发生的突变而导致产生了新的变异毒株还是只是偶然发生,以及病毒的免疫特异性等特征是否发生改变等等还有待进一步证实。