ETS1基因多态性与云南汉族系统性红斑狼疮的相关性研究

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背景:系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus, SLE)是一种以多种自身抗体产生和继发免疫复合物沉积为特点的系统性自身免疫病,本病病因复杂,受遗传、环境、激素等因素共同影响。近年来大量研究证实,遗传因素在此病易感性及临床表型方面起着决定性作用。SLE是一种多基因病,呈现非孟德尔遗传模式,有较强的种族差异性和遗传异质性。近年来国内外大量研究确定了30个易感基因,国内大样本GWAS研究又发现了5个与汉族人群发病密切相关的新的易感基因IKZF1、RASGRP3、ETS1、SLC15A4和TNIP1。目的:本研究通过用SNaPshot多重测序的方法,研究ETS1基因多态性与云南汉族人群SLE的易感性和临床表型的相关性,为进一步阐明系统性红斑狼疮的发病机制。方法:选择SLE患者565例(均符合1982年ACR 11条诊断标准中的4条以上),均为云南地区居住三代以内的汉族;同民族同地区正常对照501例。利用PCR技术扩增ETS1基因产物;以多重SNaPshot技术检测rs4937333、rs6590330的SNP;用Plink1.07软件对数据资料进行分析。结果:1. ETS1基因rs4937333的T等位基因频率在SLE组的分布明显高于对照组(p=2.1×10-7),女性SLE组明显高于女性对照组(p=1.7×10-7);rs6590330的A等位基因频率在SLE组的分布明显高于对照组(p=4.6×10-8),女性SLE组明显高于女性对照组(p=5.0×10-8)。2.ETS1基因rs4937333的TT纯合子基因型频率在SLE组的分布明显高于对照组(p=2.9×10-7),女性SLE组明显高于女性对照组(p=3.0×10-7);ETS1基因rs6590330的AA纯合子基因型频率在SLE组的分布明显高于对照组(p=4.3×10-8),女性SLE组明显高于女性对照组(p=5.2×10-8)。3.两个位点的单倍型分析,TA单倍型频率在SLE组的分布明显高于对照组p=1.9×10-7);而CG单倍型频率在SLE组的分布明显低于对照组(p=7.6×10-8)。4.病例分层后,病例组中的蝶型红斑、盘状红斑、光敏感、关节炎、浆膜炎、狼疮性肾炎、血液学异常、免疫紊乱和抗核抗体阳性与对照组之间ETS1基因rs4937333 SNP的T等位基因和rs6590330 SNP的A等位基因频率分布比较均有统计学意义(p<0.05):在rs6590330 SNP的A等位基因,蝶形红斑(p=5.5×10-7)、光敏感(p=0.0027)、关节炎(p=8.9×10-6)、浆膜炎(p=6.1×104)、狼疮性肾炎(p=7.2×10-6)、血液学异常(p=2.3×10-7)、免疫紊乱(p=1.9×10-7)和抗核抗体阳性(p=2.9x10-7);在rs4937333 SNP的T等位基因,蝶形红斑(p=8.1×10-7)、盘状红斑(p=0.04465)、光敏感(p=9.4×10-5)、关节炎(p=4.7×10-6)、浆膜炎(p=2.8×10-3)、狼疮性肾炎(p=5.9×10-6)、血液学异常(p=1.2×10-6)免疫紊乱(p=2.1×10-7)和抗核抗体阳性(p=1.1×10-6)结论:1.ETS1基因rs4937333和rs6590330多态性与云南汉族SLE的易感性相关。2.ETS1基因rs4937333 SNP的T等位基因和rs6590330 SNP的A等位基因均增加了蝶型红斑、光敏感、关节炎、浆膜炎、狼疮性肾炎、血液学异常、免疫紊乱和抗核抗体阳性的风险,其中rs4937333 SNP的T等位基因还增加了盘状红斑的风险。
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