近年来,随着政府对民生项目投资的不断加大,社会关注度不断提高,各级审计机关展开了政策措施落实情况的跟踪审计。政策落实情况跟踪审计是一种新的审计模式,目前我国还处在不断探索和发展阶段,并没有形成自己的一种独特的审计模式和方法。本文基于协同理论的研究,将协同论应用到政策落实情况审计当中,立足于创新一种全新的跟踪审计模式。论文主要采用定性与定量相结合法,理论研究与实际案例相结合法、权重计算法,运用一定的技术路线,来阐明协同审计的可操作性。同时以保障性安居房工程项目审计为例,通过常规审计模式和协同审计模式对某区2012年保障性安居房工程进行审计的具体案例比较,来进一步验证常规审计模式结合协同理论的审计效果,以及实际可实施性和操作性。最后根据政策落实情况跟踪审计的现状以及效果,提出有针对性的对策和建议。