拟南芥hydra3突变体的图位克隆

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图位克隆技术是一种广泛的应用于突变体突变基因定位的一种技术.在拟南芥中,随着Col-0(Columbia-0)和Ler(Landsberg erecta)的基因组测序完成而产生的大量信息,又把图位克隆技术大大地向前推进了一步.许多有价值的序列多态和分子标记的发现,为基于PCR(polymerase chain reaction)技术的简单精细定位提供了更加有效的支持.现在,可以用更短的时间,花更少的精力就完成图位克隆这项工作了.我们在用EMS制作突变体时发现了一株突变体,根和下胚轴都很短,叶子卷曲呈卷心菜状,与甾醇突变体hydral以及hydra2(fackel)表型非常相似,将其命名为hydra3.通过启动子加报告基因的研究显示除IAA14启动子在该突变体中表达异常外,其它,如:DR5、IAA2、AUX1、CHL1和SCR,都表达正常.我们还展开了一些基于PCR技术的图位克隆工作:利用16个SSLP标记将hyd3粗略定位于5号染色体末端;依靠TAIR网站提供的6个SSLP标记、4个CAPS标记以及两个自己设计的SSLP标记将该基因精细定位到24860kb-25494kb之间.
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