基于TILING的小麦淀粉合成关键基因突变体发掘与发达分析

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mayf014
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本实验室已经利用EMS构建了小麦品种京411的M2代突变群体,并从Agp2B、Wx-A1、SSⅡ-A、SSⅡ-B和SBE1等5个淀粉合成关键基因中筛选获得多个点突变。在此基础上,本研究利用TILLING技术筛选SSⅣ基因的突变体,并在M3代检测SSⅣ以及Agp2B、Wx-A1、SSⅡ-A、SSⅡ-B、SBE1等6个基因的点突变对其基因表达水平和籽粒淀粉含量的影响。主要结果如下:  1.利用TILING技术筛选京411的M2代突变群体,获得SSⅣ基因的54个点突变,SSⅣ基因在群体中的突变密度为1/198.82kb。其中1个无义突变、2个剪接突变和22个错义突变。无义突变C2188T,使相应肽链在第269位提前终止。2个剪接突变均发生在第7内含子第一个碱基,即第3825位,G转换为A。22个错义突变中,PARSENP预测T1991C、C2254Y、C4061T和G6438A可能将严重影响蛋白质功能。  2.选择预测可能影响蛋白质功能的13个SSⅣ基因突变单株繁殖成M3代,包括1个无义突变,2个剪接突变和10个错义突变。无义突变的M3代纯合单株中SSⅣ基因的表达非常微弱,可能无义突变使相应mRNA因提前终止翻译而被降解。剪接突变的M3代纯合单株中检测到5种不同的mRNA剪接方式:保留第6、7、8内含子,保留第7、8内含子,保留第7内含子,第7外显子随第6、7内含子被切除,第7、8外显子与第6、7、8内含子一起被切除。5种剪接方式均改变了SSⅣ因的读码框,提前产生终止密码子使其蛋白质产物丢失C-端的ADP结合位点,可能丧失催化功能。  3.检测M3代的Agp2B基因,获得6个错义突变。其中A422、E2-2-427、E3-1-3等3个突变系的Agp2B基因表达量在籽粒发育不同时期显著降低,E3-1-3株系的籽粒淀粉含量显著下降9.1%。Agp2B基因在开花后24天仍然维持较高的表达水平,表明该基因可能在灌浆后期对维持AGPase酶活性,促进籽粒淀粉合成有重要作用。  4.在M3代检测Wx-A1基因的6个点突变、SSⅡ-A基因的12个点突变以及SSⅡ-B和SBE1基因各3个点突变,发现Wx-A1和SSⅡ-B基因的所有点突变、SSⅡ-A基因的3个错义突变可以稳定遗传,而SSⅡ-A基因的其他9个点突变以及SBE1基因的所有点突变没有在后代检测到。未检测到突变的可能原因是突变的分离比较小,也可能在M3代回复突变或者丢失。  以上研究证实,采用TILLING技术检测获得的点突变可在后代稳定遗传,并影响基因的表达及相关表型,这些突变材料可进一步用于基因功能分析和品质育种研究。
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