靶向人FoxMlc的多肽先导药物筛选与分子模拟

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恶性肿瘤是严重危害人类生命健康的重大疾病。在与肿瘤相关的各类转录因子中,Fox家族蛋白成员众多,其突变和表达异常与发育畸形、代谢性疾病以及肿瘤发生密切相关。FoxM1作为Forkhead家族的一个特殊成员在肿瘤等活跃的分裂细胞中大量表达,是控制包括增殖、成熟、死亡在内的整个细胞生命周期的重要基因之一,与肿瘤生长和转移密切相关。目前,国内外对FoxM1的研究尚处于起步阶段。本研究对于深入了解FoxM1c的生物信息基础和进一步的靶向FoxM1c药物研究具有重要的意义和价值。通过NCBI FoxMlc基因的蛋白质序列查询,选出8条来自不同物种具有代表性的序列,确定了不同物种中表达FoxM1c基因之间的同源关系,并发现FoxM1c基因或功能区域在其它物种中的表达。同时,依据ClustalX等生物信息学软件对人FoxMlc基因蛋白序列的理化性质、结构以及功能进行预测。研究结果表明,人FoxM1c蛋白序列共有748个氨基酸组成,人FoxM1c蛋白序列的两大功能域分别为“叉头框”(Forkhead,236-314)和转录激活区(AD,688-748),“叉头框”是一个非常好的保守区域。p19ARF蛋白的26-46的氨基酸残基能与AD相结合,从而约束人FoxM1c和减少人FoxM1c对细胞核靶向作用的转录活性。进一步地,通过对人FoxM1c全长片段、DNA结合区和转录激活区的PCR扩增和表达载体pQE30的重组,成功构建了各相应的重组表达系统。经SDS-PAGE凝胶电泳,确认DNA结合区成功表达。在此基础上,对DNA结合区表达系统pQD进行大量表达并通过Ni-NTA亲和层析进行蛋白纯化与定量,获得了mg级的DNA结合区蛋白。以FoxM1c的DNA结合区蛋白为筛选靶标,利用噬菌体随机十二肽库筛选技术,通过“吸附—洗脱—扩增”的循环筛选获得富集噬菌体,经4轮筛选,将最后一轮筛选富集的噬菌体铺板,挑取单克隆噬菌体制备ssDNA并测序获得18条不同序列的十二肽。经分子对接软件MVD进行对接,靶向FoxM1的DNA结合区蛋白的富集噬菌体至少含有以下一种多肽结构序列:第一组:WHL/Q/D/N;第二组:DLY, DLLY, DHYN,DLNY;第三组:SSLWN/E;第四组:HLDY, HLYE, YHLE, LYHDD, YHLEE;第五组FYNL, NYFL;第六组:YPH, YPL, YPS。所述结合肽多肽结构序列分子模拟对接在FoxM1上的结合结构域预测主要是Arg-Arg(R-R, aa:254,256)和Glu-Thr-Ser-Ala-Asn-Gly-Lys(E-T-S-A-N-G-K, aa:298-304)。为进一步的靶向FoxM1c小分子先导肽的发现建立了基础。
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