【摘 要】
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本文提出了一种新的用于描述蛋白质表面几何性质的方法—平滑原子体积分数方法。该方法可以准确地刻画蛋白质表面的凸凹性质,是对前人蛋白质表面原子凸出指数方法的一种改进
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本文提出了一种新的用于描述蛋白质表面几何性质的方法—平滑原子体积分数方法。该方法可以准确地刻画蛋白质表面的凸凹性质,是对前人蛋白质表面原子凸出指数方法的一种改进。另外,本文将蛋白质相互作用位点细分为相互作用位点中心区域和相互作用位点边缘区域,称为相互作用位点的精细结构。通过对同源二聚体,异源二聚体凸起、凹陷三种相互作用位点的精细结构的若干蛋白质几何学参数的统计研究,发现在相互作用位点中心区域和相互作用位点边缘区域这些蛋白质几何学参数具有显著的不同。特别地,平滑原子体积分数具有更高的差异显著性,这预示着平滑原子体积分数可以应用于蛋白质相互作用位点的预测。
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