基于DNA条形码(ITS2)的绞股蓝与其混伪品的分子鉴定

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[目的]  探讨基于ITS2序列的鉴定绞股蓝与其混伪品的新方法,以确保该药材的质量以及临床疗效。  [方法]  1.利用PCR测序法,对样品进行ITS2片段扩增并双向测序。所得序列经CodonCode Aligner拼接后,用CLUSTALX1.83软件进行多重序列比对及分析。  2.通过ITS2数据库预测ITS2二级结构。  3.用软件MEGA4.0进行K2P遗传距离分析。  4.用最大简约法(MP)构建系统发育树。  [结果]  1.绞股蓝与其混伪品的ITS2序列存在相当大的差异。  2.分析ITS2二级结构发现,绞股蓝与其混伪品在4个螺旋区的茎环数目、大小、位置以及螺旋发出时的角度均有明显差异。  3.绞股蓝最大种内K2P(Kimura-2-parameter)遗传距离远远小于其与混伪品的种间K2P遗传距离。  4.由所构建的系统发育树图可以看出,绞股蓝与其混伪品可明显分开。  [结论]  ITS2序列作为DNA条形码可以方便快捷地鉴别绞股蓝及其混伪品,为其种质资源鉴定及临床安全用药提供了重要分子依据。
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