乳腺癌血清差异表达microRNA筛选和临床应用研究

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目的:  microRNA(miRNA)是一组非编码小RNA,主要在转录后水平对基因表达行负调控功能。有研究表明,miRNA的异常表达与乳腺癌密切相关。本研究通过筛选验证乳腺癌血清差异性表达miRNA,探讨其作为乳腺癌肿瘤标志物的可行性、对乳腺癌的临床诊断价值以及联合CA15-3检测的临床意义。  方法:  1.分别收集8例乳腺癌组织和癌旁正常组织标本,以及各8例乳腺癌血清和正常对照血清标本。利用二代高通量测序技术Illumina Hiseq2500筛选出乳腺癌血清和乳腺癌组织共同显著性差异表达miRNAs。  2.收集100例乳腺癌血清和40例正常对照血清标本,利用茎环设计的反转录引物,通过实时荧光定量PCR技术验证前期筛选出的miRNAs,得到乳腺癌血清差异性表达miRNAs。分析乳腺癌相关miRNAs与乳腺癌诊断、TNM分期、病理等指标的关系。采用Logistic逐步回归方法筛选出有效miRNAs,建立乳腺癌miRNAs回归方程。应用ROC曲线分析miRNAs对乳腺癌的临床诊断价值,包括:灵敏度、特异性等。  3.利用化学发光微粒子免疫分析法检测乳腺癌血清中CA15-3的含量,应用ROC曲线分析血清miRNAs联合CA15-3对乳腺癌诊断的临床意义。  4.统计学处理:实验数据采用SPSS统计软件(17.0版)进行处理。检测结果均以((x)±S)表示。miRNAs的相对表达量=2-ΔΔCt,ΔΔCt=(CtmiRNA-CtmiR-39)肿瘤-(CtmiRNA-CtmiR-39)正常组平均值,以Cel-miR-39为参照基因。采用独立样本t检验、Mann-Whitney U检验和Kruskal-Wallis T检验比较分析,P<0.05有统计学意义。  结果:  1.利用二代高通量测序技术Illumina Hiseq2500筛选出10个乳腺癌血清和组织共同显著性差异表达miRNAs:miR-132-5p、miR-125b-1-3p、miR-34c-5p、miR-382-3p、miR-485-5p、miR-323b-3p、miR—598-3p、miR-224-5p、miR-1246、miR-184。  2.利用实时荧光定量PCR技术验证得到4个乳腺癌血清差异性表达miRNAs:miR-382-3p、miR-598-3p、miR-1246、miR-184。与对照组比较,乳腺癌血清中miR-382-3p和miR-1246表达上调,miR-598-3p和miR-184表达下调,差异均有统计学意义(P<0.05),其表达水平均与乳腺癌患者的临床TNM分期无相关性(P=0.581,P=0.750,P=0.593,P=0.678)。  3.通过Logistic逐步回归分析筛选出3个有效miRNAs:miR-382-3p、miR—598-3p和 miR-1246,得出Logistic回归方程P=1/[1+e-(1.304X1-5.793X2+2.604X3-1.313)](方程中的X1、X2、X3分别代表miR-382-3p、miR-598-3p、miR-1246的相对表达量)。  4.ROC曲线结果显示:miR-382-3p、miR-598-3p、miR-1246的ROC曲线下面积分别为0.740、0.939、0.904,检测乳腺癌的敏感度和特异性分别为52%,92.5%;95%,85%;93%,75%。三者联合检测的AUC是0.982,敏感度和特异性是92.5%、99.6%。  5.CA15-3诊断乳腺癌的灵敏度和特异性为66%、65%。miR-598-3p、miR-1246联合CA15-3检测乳腺癌的灵敏度和特异性为96%、95%。  结论:  乳腺癌血清miR-382-3p、miR-598-3p、miR-1246、miR-184具有显著性差异表达。其中miR-382-3p、miR-598-3p、miR-1246为乳腺癌的有效诊断指标,均有较好的灵敏度和特异性,具备作为乳腺癌肿瘤标志物的潜能,三者联合检测比单一检测可以提高乳腺癌诊断效能。CA15-3诊断乳腺癌的灵敏度和特异性较低,较之miR-382-3p、miR-598-3p、miR-1246三者联合,CA15-3联合miR-598-3p、miR-1246可以提高乳腺癌诊断的敏感度,但特异性降低。
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