进入新世纪以来，高校之间的合并在全国各地大规模展开，在行政力量的推动下，组建了一大批学科综合、规模巨大、实力较强的新型高校。高校合并的目的是提高综合实力、竞争力，整合优质资源、打造高校品牌，适应社会需求、全面培养新型人才，但合并高校的文化融合创新面临的问题突出，这些问题增加了内耗，导致了资源的浪费，严重影响了实质性合并的进程，这也正是我们研究合并高校文化融合创新的重要背景。如何解决合并过程中的文化冲突，有效地推进合并高校文化的融合与创新?这也正是本文研究的重点和创新之处。本文从我国合并高校面临的文化融合创新问题入手，分析了高校合并目的，提出以先进文化为体，坚持合并高校文化发展的正确方向：多元并存，突出主导：取长补短，整体优化；融合创新，形成特色四条进行文化融合创新的原则。在提出原则的基础上论述了解决合并高校文化融合、创新、发展问题的具体做法，着重强调了存异求同，以共有文化基因为基础，创新发展；异异整合，互补创新；立足共同城市文化背景，促进合并高校文化创新；以主导精神文化为统领，统筹制度文化、物质文化；以优势校区精英文化为核心，构建合并高校文化生态系统的观点，这些观点的提出对于合并高校文化融合创新的实践有一定的参考价值。