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棘豆属(Oxytropis)的小花棘豆(O.glabra)、刺叶柄棘豆(O.aciphylla)、砂珍棘豆(O.racemusa)在内蒙古的草原区和荒漠区广为分布,它们不仅是有药用价值的经济植物,还有重要的生态和饲用价值。其中小花棘豆对牲畜而言是毒草,然而其有毒成分苦马豆素却是很有潜力的抗肿瘤药物。本研究采用高效液相色谱-质谱联用(LC-MS)法测定了三种棘豆植物的苦马豆素含量;通过ISSR分子标记技术对三种棘豆种群遗传多样性及其苦马豆素相关标记进行了研究;将小花棘豆植物单株进行体外真菌培养,研究了菌落和分生孢子的微生物形态学特性,从植物总DNA和相同植株培养的真菌总DNA扩增真菌的5.8SrDNA/ITS区,进行了DNA序列分析与排序;联系单株小花棘豆的苦马豆素含量测定和内生真菌ITS序列分析结果,与从美国分布的二种棘豆(O.lambertii、O.sericea)和一种黄芪(A.mollisimus)中分离的内生真菌埃里砖格孢属Embellisia sp.L12株得到的结果进行了比较。研究结果表明:刺叶柄棘豆、砂珍棘豆各种群均未测出苦马豆素,也未扩增出上述真菌特异条带,二种棘豆不会导致家畜中毒,因而不是疯草。小花棘豆6个地理种群90株中有65株扩增出上述真菌特异条带,其中51株测出苦马豆素,含量随种群、不同植株变化很大,小花棘豆是疯草;其变种细叶小花棘豆伊金霍洛OY2种群未测出苦马豆素,也未扩增出上述真菌特异条带,而同地采集的小花棘豆却测出苦马豆素,细叶小花棘豆对牲畜无毒。ISSR-PCR扩增条带表现了三种棘豆各种群具有丰富的多态性,种群间的差异主要是基因频率不同,在不同种群中也有一些特异位点。遗传多样性分析表明三种棘豆都存在着较高的遗传多样性,且种群内的遗传变异是主要成分。小花棘豆6个种群的14个ISSR引物的扩增图谱中,没有发现含苦马豆素的植株有特异的ISSR的扩增条带。分子生物学与微生物学的相关研究表明体外培养的内蒙古小花棘豆内生真菌属于Embellisia属真菌。比较内生真菌5.8SrDNA/ITS扩增和宿主苦马豆素含量测定的结果,发现多数小花棘豆中有内生真菌与植物含苦马豆素之间相对应。通过对小花棘豆10株内生真菌与A.mollisimus、O.lambertii和O.sericea的内生真菌Embellisia sp.L12株的的5.8SrDNA/ITS序列分析发现,全长517bp的10个内蒙古小花棘豆的序列完全相同,10个序列与Embellisia sp.L12株的序列只有1个碱基的差异,位于5.8SrDNA区,而ITS1、ITS2区高度保守,11个5.8SrDNA/ITS序列一致度很高。该内生真菌的物种鉴定需要继续深入研究。