夏南牛育种管理系统开发及育种效果分析和微卫星标记分析

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本研究建立了夏南牛育种管理系统,估计了夏南牛主要生长性状的遗传参数和夏南牛种公牛的育种值,并分析了影响夏南牛生长性状的部分因素。本研究还采用微卫星标记技术分析了夏南牛群体遗传变异及体尺性状与微卫星DNA标记的相关性,同时,利用模糊数学评价了夏南牛在我国部分地区的适应性。主要研究内容如下:试验一:夏南牛育种管理系统的设计与开发采用Visual FoxPro 6.0数据库技术设计和开发了夏南牛育种管理系统。系统主要包括种公牛管理、南阳牛导血育种杂种后代、夏南横交牛信息、横交中间试验杂交后代、核心群母牛管理、南阳牛母牛导血配种登记、系统维护和退出系统八个模块,实现了对夏南牛育种过程中数据资料的输入、浏览和查询功能。试验二:夏南牛核心群母牛部分生长性状遗传参数及种公牛育种值的估计利用动物模型和MTDFREML方法估计了1992—2005年间的夏南牛的部分生长性状,包括6月龄、12月龄、18月龄的体高、体长、胸围、后腿围和管围的遗传参数。结果表明:夏南牛各体尺性状的遗传力在0.31~0.60之间;6月龄、12月龄和18月龄体尺之间的遗传相关分别在0.72~0.94、0.71~0.88和0.73~0.95之间;各体尺性状在不同年龄之间的遗传相关在0.87~0.95之间。同时,用单性状动物模型BLUP法估计了夏南牛种公牛18月龄体高、体长、胸围、后腿围和管围5项体尺性状的育种值。结果表明:213号公牛除胸围育种值不在前10位外,其余几项指标育种值均在前2位;104号公牛除体长育种值不在前10位外,其余几项指标育种值均在前2位;213、104、248号三头公牛各性状的育种值均排在前10位。在此基础上,利用主成分分析法对27头夏南牛种公牛的5项体尺性状育种值进行了综合评价。5项原始指标被综合成三个主成分,筛选出的3个主成分包含了原有指标的大部分信息,累积贡献率达到97.002%。通过比较3个主成分的综合得分大小对排名前10名的种公牛进行了排序,结果表明:编号213的夏南牛种公牛的5项体尺性状综合育种值排名第一,编号104的种公牛次之,种公牛的具体排名顺序如下: 213>104>286> 201>103>266>248>278>1516>0007。试验三:夏南牛核心群母牛部分生长性状影响因素的分析利用SAS统计分析软件中的GLM过程分析了不同出生年度、不同出生季节和不同代次对夏南牛体尺性状的影响。结果表明:出生年度和代次对夏南牛各年龄阶段体尺性状的影响显著;出生季节对夏南牛各年龄阶段体尺性状的影响不显著。试验四:夏南牛群体遗传变异与体尺性状的微卫星DNA标记研究选用8个微卫星DNA标记,研究了夏南牛群体遗传变异,并分析了体尺性状与8个微卫星标记的关系。结果表明:8个微卫星标记BM2113、BM1824、ETH225、IDVGA2、IDVGA46、IDVGA55、BM3413和TGLA44等位基因数分别为7、6、6、6、6、4、6和6,多态信息含量分别为0.764、0.775、0.786、0.701、0.723、0.570、0.759和0.776,杂合度分别为0.801、0.784、0.824、0.744、0.772、0.648、0.802和0.815。8个微卫星标记分别对夏南牛不同体尺性状存在正效应或负效应。试验五:利用模糊相似优先比方法评价夏南牛的引种适应性本研究选取对肉牛生产影响较大的六个气候因子(包括最高气温、七月平均气温、气温年较差、年平均湿度、无霜期和年日照时数)和我国气候特点有代表性的10个地区(包括北京、哈尔滨、石家庄、南京、武汉、上海、贵州、昆明和广州),利用模糊数学相似优先比方法方法对夏南牛在我国不同地区的适应性进行了分析。结果表明:夏南牛在10个地区的适应性排序为:南京>上海>北京、石家庄>长春>哈尔滨>广州>昆明>呼和浩特。
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