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Pt-MyD88和Pt-TRAF6是三疣梭子蟹Toll信号通路中关键接头蛋白分子，在甲壳动物先天免疫应答反应中起着重要的作用。本研究利用常规 PCR和RACE技术首先获得了三疣梭子蟹 Pt-MyD88和 Pt-TRAF6基因的cDNA全长，Pt-MyD88全长1736bp，开放阅码框（ORF）长1410bp编码469个氨基酸，Pt-TRAF6全长2251bp,ORF长1800bp编码599个氨基酸。对目的基因蛋白序列进行同源性分析发现，Pt-MyD88和 Pt-TRAF6与甲壳动物相似性最高。通过实时荧光定量PCR分析Pt-MyD88和Pt-TRAF6在梭子蟹不同组织中的分布，结果显示 Pt-MyD88在血，鳃，肠道，心脏表达量比较高，在肌肉中表达量最低，Pt-TRAF6在鳃和血中表达量较高，肠道，心脏，肌肉表达量较低。同时利用实时荧光定量PCR检测在不同温度和盐度胁迫条件下Pt-MyD88和Pt-TRAF6的表达量变化，结果发现不同温度和盐度下Pt-MyD88和Pt-TRAF6的表达无显著差异。用病原微生物假丝酵母菌，溶藻弧菌，WSSV及脂多糖（LPS）分别刺激健康梭子蟹，定量PCR检测Pt-MyD88和Pt-TRAF6的表达量变化发现，Pt-MyD88在假丝酵母菌，溶藻弧菌和LPS刺激后，鳃中表达量显著上调，WSSV刺激后，血中表达量显著上调。溶藻弧菌，LPS，WSSV刺激后Pt-TRAF6在鳃中的表达量明显上调，在血中则相反。说明Pt-MyD88和Pt-TRAF6确实在梭子蟹先天免疫应答反应中扮演者重要的作用。通过构建重组质粒 pEGFP-N2-MyD88和pEGFP-N2-TRAF6，并将之转染进HEK293T细胞系中，成功的在细胞中正确表达了梭子蟹Pt-MyD88和Pt-TRAF6蛋白。利用激光共聚焦扫描显微镜对其在细胞中定位，发现其皆在细胞质中表达。本研究为深入研究Pt-MyD88和Pt-TRAF6在甲壳动物的先天免疫应答所扮演的角色奠定了理论基础，同时在阐明梭子蟹的抗病机理方面也具有潜在意义。