结节性硬化症致病基因的初步筛查

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背景:结节性硬化症(TSC)是一种常染色体显性遗传的多系统、多器官病变的神经皮肤综合征,病理特征是良性的非侵袭性的肿瘤样的病变(错构瘤)。其病变常常于胚胎期就已形成。显著的临床特征是面部皮脂腺瘤、癫痫发作和智能减退。目前研究该病的致病突变主要位于TSC1和TSC2两个基因,分别编码错构瘤蛋白和马铃薯球蛋白,但15%的患者致病突变不明确。其发病机制与m TOR通道的活性有关,持续活跃的m TOR途径是TSC发病的分子基础。m TOR抑制剂可用于TSC的一些临床表现的治疗。目的:对结节性硬化症(Tuberous sclerosis complex,TSC)一家系进行全外显子组测序找到可疑的致病突变位点,并用sanger测序法进行验证,从而明确本家系的致病基因。方法:对本家系患者进行临床诊断,总结患者临床-遗传特点,构建标准家系图,并选取6名家系成员作为待测样本。应用新一代高通量外显子组测序的方法对家系中的6名家系成员进行全外显子组测序分析。运用注释软件Ion Reporter注释后再对比db SNP、HAPMAP等数据库,滤过已知的无意义单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP),然后筛选出影响蛋白功能的候选基因,并对候选基因进行分析,最后筛选出最可能的异位点。并通过Sanger测序法检验结果。结果:本家系的6个样本通过全外显子测序结合Sanger测序,未发现TSC致病基因突变位点。结论:TSC1和TSC2基因外显子区非本TSC家系的致病突变区。
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