食品企业污水中含有各种无机污物和有机污物，同时还含有很多细菌，包括大肠杆菌、可能存在的致病细菌和杂菌等，因此水质混浊而脏臭。同时，由于污水处理效率低(估计仅为20％～30％)，大部分污水未经妥善处理就直接或间接排入水体，恶化水质，污染环境，其中夹带的致病菌，将导致多种疾病的爆发和流行，严重威胁着人类的健康。 为了快速、准确地检测食品企业污水中存在的细菌，建立一种采用基因芯片技术对食品企业污水中常见细菌检测和鉴定的实验方法。 从上海部分食品企业采集污水水样后进行纯种分离培养，从第一期水样中获得38株纯种菌种样本；第二期水样培养后，又分离出20株纯种菌种样本。对两期培养所得菌种进行鉴定，共得12株纯种细菌。此次实验中的绝大多数细菌都为革兰氏阴性杆菌，且绝大多数菌种为好氧型菌，其余为兼性菌，并不存在厌氧性菌。 实验中设计了8对特异引物并将8对引物分成两组进行PCR反应：引物Ⅰ为(Kp+HlyA+InvA+ipaH)；引物Ⅱ为(Cadc+OprI+Ent+23SrRNA)效果良好。 通过实验摸索，适宜的PCR反应循环数为35个循环，确定适宜杂交温度为48℃，洗片采用洗液A和洗液B。 本实验所涉及的7种细菌中，O157:H7型大肠杆菌和沙门氏菌的检测浓度可以低至10-3μg/ml，在整个扩增体系中达到pg级；即使是敏感性相对较低的肺克菌、绿脓杆菌、肠球菌和志贺氏菌，其检测下限也为10-1μg/ml。实验中所制作的基因芯片对目的细菌检测的敏感性是很高的。 随机选择肺炎克雷白(Kp)、大肠杆菌(Cadc)和沙门氏菌(InvA)为代表进行芯片重复性检测实验，根据PCR产物电泳结果和芯片杂交扫描结果验证芯片检测的重复性。检测结果表明，用实验中制备的基因芯片检测上述3种细菌具有良好的重现性。 用实验制备的基因芯片对模拟水样检测的结果与疾控中心配制的菌液相比较，准确率100％，说明该基因芯片对目的细菌特征基因的检测结果是可靠的，并用该方法对从实际水样中分离的细菌进行了检测，具有高准确率。该项技术的建立为今后更大规模的检测研究奠定了基础。