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亚洲大陆石斛属主要分布于亚洲大陆的亚热带常绿阔叶林和热带山地常绿阔叶林。本研究在亚洲大陆石斛属分子系统学研究的基础上,研究亚洲大陆石斛属的起源和分化,对亚洲大陆石斛属的多样化过程和原因进行了全面的分析。主要包括以下几个方面: ⑴在整个石斛属的取样的基础上,着重加强亚洲大陆石斛属植物的取样,利用4个叶绿体基因组片段(rbcL,matK, trnL,trnH-psbA)和1个核基因组片段(ITS),对亚洲大陆石斛属进行了系统发育框架重建。联合数据矩阵分析结果表明:BI(Bayesian inference)、ML(Maximum likelihood)、MP(Maximum parsimony)三种分析方法的结果基本一致。亚洲大陆石斛属是单系类群,各组的单系性得到非常高的支持,但是各组之间的关系并不明确且枝长很短,可能是快速分化的结果。 ⑵在系统发育的基础上,我们对亚洲大陆石斛属植物的生物地理进行了研究。海拔重建的结果显示:低海拔是祖征,主要出现在Australasian clade和Asianclade的基部分支;高海拔是衍征,出现在近期分化的类群,比如Sect.Formosae,Sect.Stachyobium和Sect.Dendrobium。分子中计算结果表明石斛属最有可能于晚始新世(39.43 Mya)在东亚和中南半岛起源,之后分成两支Australasian clade和Asian clade。亚洲大陆石斛属最有可能在中南半岛和东亚分化,各个分支的起源时间集中在渐新世晚期和中新世早期的十个百万年。亚洲大陆石斛属在短时间内的快速分化,可能与该区域的气候有关,相关性较强的可能就是东亚季风的起源。 ⑶多样化分析表明石斛组的分化速率不是恒定的,石斛组形成之后分化速率降低,在15Mya有一个速度增加的过程。通过对石斛组植物的生长环境亚洲常绿阔叶林的分析,我们认为石斛组植物的多样化速度增快时期为常绿阔叶林分布范围扩大的时期。同时,这个时期也可能是东亚季风加强的时期。亚洲大陆石斛属草叶组主要分布于喜马拉雅山前热带的高海拔区域,起源时间为24.38Mya;而海拔重建表明草叶组高海拔是衍生状态,可能是适应喜马拉雅山脉快速隆升的结果。本研究为喜马拉雅山脉在20-25Mya快速隆升提供了新的生物学证据。